| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-27页 |
| ·硝化作用和硝化细菌 | 第12-17页 |
| ·氮循环概述 | 第12-16页 |
| ·好氧氨氧化细菌 | 第16-17页 |
| ·好氧氨氧化细菌分子生态学研究进展 | 第17-24页 |
| ·AOB 分子生态学研究目标 | 第18-19页 |
| ·AOB 分子生态学研究手段 | 第19-22页 |
| ·AOB 分子生态学研究现状 | 第22-24页 |
| ·研究意义和目的 | 第24-27页 |
| 第二章 长江口及邻近海域沉积物中好氧氨氧化细菌多样性研究 | 第27-44页 |
| ·实验材料和仪器 | 第27-29页 |
| ·样品采集 | 第27-28页 |
| ·主要试剂 | 第28页 |
| ·主要仪器 | 第28-29页 |
| ·实验方法 | 第29-32页 |
| ·DNA 提取 | 第29-30页 |
| ·amoA 基因的 PCR 扩增 | 第30页 |
| ·PCR 产物的克隆、测序 | 第30-31页 |
| ·序列分析 | 第31-32页 |
| ·核酸序列登录号 | 第32页 |
| ·结果与分析 | 第32-40页 |
| ·检验阳性克隆 | 第32-33页 |
| ·amoA 基因序列分析 | 第33-35页 |
| ·系统进化分析 | 第35-40页 |
| ·讨论 | 第40-43页 |
| ·结论 | 第43-44页 |
| 第三章 长江口及邻近海域沉积物中好氧氨氧化细菌 amoA 基因荧光定量 PCR 检测方法的构建 | 第44-55页 |
| ·实验材料和仪器 | 第44-46页 |
| ·样品采集 | 第44-45页 |
| ·主要试剂 | 第45页 |
| ·主要仪器 | 第45-46页 |
| ·实验方法 | 第46-47页 |
| ·DNA 提取 | 第46页 |
| ·amoA 基因的 PCR 扩增 | 第46页 |
| ·质粒标准品的制备 | 第46页 |
| ·标准曲线的建立 | 第46-47页 |
| ·减轻干扰的实验方法 | 第47页 |
| ·结果与分析 | 第47-52页 |
| ·克隆测序结果 | 第47-48页 |
| ·标准曲线 | 第48页 |
| ·定量 PCR 实验方法改进 | 第48-51页 |
| ·沉积物中 amoA 基因定量 PCR 检测 | 第51-52页 |
| ·讨论 | 第52-53页 |
| ·结论 | 第53-55页 |
| 第四章 长江口及邻近海域沉积物中好氧氨氧化细菌 amoA 基因荧光定量 PCR 检测 | 第55-64页 |
| ·实验材料和仪器 | 第55页 |
| ·样品采集 | 第55页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第55页 |
| ·实验方法 | 第55-56页 |
| ·DNA 提取 | 第55-56页 |
| ·amoA 基因的 PCR 扩增 | 第56页 |
| ·质粒标准品的制备 | 第56页 |
| ·标准曲线的建立 | 第56页 |
| ·样品测定 | 第56页 |
| ·结果与分析 | 第56-61页 |
| ·标准曲线 | 第56-57页 |
| ·不同深度 amoA 基因拷贝数变化 | 第57-59页 |
| ·不同季节 amoA 基因拷贝数的变化 | 第59-61页 |
| ·讨论 | 第61-62页 |
| ·结论 | 第62-64页 |
| 总结与展望 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-73页 |
| 附录 | 第73-75页 |
| 致谢 | 第75-77页 |
| 个人简历 | 第77页 |
| 发表的学术论文 | 第77页 |
