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柔红霉素产生菌dnmV基因阻断突变和功能替换研究

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
缩写第11-12页
第1章 绪论第12-35页
   ·蒽环类抗生素简介第12-16页
     ·柔红霉素第12-13页
     ·阿霉素第13页
     ·表阿霉素第13-14页
     ·作用机制第14页
     ·表阿霉素的化学半合成方法第14-16页
   ·柔红霉素的生物合成途径第16-19页
     ·第一阶段 ε-紫红霉酮的生成第17页
     ·第二阶段 TDP-柔红糖胺的合成及糖苷化反应第17-19页
     ·第三阶段 后修饰形成柔红霉素及阿霉素第19页
   ·链霉菌中基因敲除和基因置换第19-27页
     ·常用方法第19-23页
     ·选择方法时的考虑因素第23-24页
     ·同源片段的导入方法第24-25页
     ·选择标记第25-27页
   ·抗生素分子中脱氧糖组合生物合成第27-33页
     ·糖生物合成基因第27-29页
     ·糖苷转移酶基因第29页
     ·糖C4酮基还原酶基因第29-30页
     ·利用产生菌作为细胞工厂改造脱氧糖结构第30-32页
     ·用非产生菌做细胞工厂改造脱氧糖结构第32-33页
     ·体外随机糖苷化第33页
   ·本工作的立题意义及研究内容第33-35页
第2章 C4酮基还原酶基因的克隆及序列分析第35-59页
   ·实验材料第35-38页
     ·菌种和质粒第35-36页
     ·培养基第36-37页
     ·试剂第37-38页
     ·主要仪器和设备第38页
   ·实验方法第38-43页
     ·菌种的培养和保藏第38-39页
     ·链霉菌基因组DNA的提取第39页
     ·PCR反应体系第39-40页
     ·PCR反应程序第40页
     ·大肠杆菌感受态细胞制备第40-41页
     ·大肠杆菌质粒转化(CaCl_2法)第41页
     ·大肠杆菌质粒分离第41-42页
     ·DNA片段的回收第42页
     ·PCR产物亚克隆第42页
     ·分析软件第42-43页
   ·实验结果第43-57页
     ·dnmU+dnmV连锁基因的克隆分析第43-47页
     ·PCR扩增dnmV基因及其亚克隆第47-48页
     ·几种抗生素产生菌基因组的提取第48-49页
     ·aveBIV基因的克隆分析第49-52页
     ·oleU基因的克隆分析第52-55页
     ·novS基因的克隆分析第55-57页
   ·实验讨论第57-58页
   ·结论第58-59页
第3章 dnmV基因的阻断(一)——同源重组单交换法第59-76页
   ·实验材料第59-62页
     ·菌种和质粒第59-60页
     ·培养基第60-61页
     ·主要溶液和缓冲液第61页
     ·试剂第61-62页
     ·主要仪器和设备第62页
   ·实验方法第62-67页
     ·链霉菌原生质体制备第62页
     ·链霉菌质粒转化第62-63页
     ·链霉菌质粒提取第63-64页
     ·PCR扩增安普霉素抗性基因第64页
     ·柔红霉素产生菌的发酵培养和产物分析第64-65页
     ·发酵产物中未知主产物的鉴定:第65页
     ·Southern Blotting第65-67页
   ·实验结果第67-74页
     ·SIPI-1482的抗生素耐受浓度第67页
     ·重组质粒的构建第67-69页
     ·重组质粒(以下以pYG807为例)转化S.lividans TK24原生质体第69-71页
     ·重组质粒转化SIPI-1482原生质体第71页
     ·破坏子的筛选及验证第71-73页
     ·发酵结果第73-74页
   ·实验讨论第74页
   ·结论第74-76页
第4章 dnmV基因的阻断(二)——同源重组双交换法第76-84页
   ·实验材料第76-77页
     ·菌种和质粒第76-77页
     ·培养基第77页
   ·实验方法第77-78页
     ·质粒碱变性单链化条件第77页
     ·重组质粒的构建第77页
     ·同源重组质粒转化链霉菌前的预处理第77-78页
   ·实验结果第78-82页
     ·重组质粒的构建第78-79页
     ·同源重组质粒的转化及重组菌的筛选第79页
     ·双交换重组菌的验证第79-81页
     ·双交换重组菌的发酵产物分析第81-82页
     ·基因阻断突变株的遗传稳定性分析第82页
   ·实验讨论第82-83页
   ·结论第83-84页
第5章 C4酮基还原酶表达质粒的构建及工程菌发酵第84-94页
   ·实验材料第84-85页
     ·菌种和质粒第84-85页
     ·培养基第85页
     ·试剂第85页
   ·实验结果第85-92页
     ·重组质粒pYG810的构建第85-87页
     ·重组质粒pYG812的构建第87-88页
     ·重组质粒pYG810、pYG812转化双交换重组菌12#第88页
     ·重组质粒pYG820的构建第88-89页
     ·重组质粒pYG821的构建第89-91页
     ·含有各表达质粒的12#菌的发酵第91-92页
   ·实验讨论第92-93页
   ·结论第93-94页
第6章 C4酮基还原酶的整合表达及表柔红霉素工程菌的研究第94-112页
   ·实验材料第94-95页
     ·菌种和质粒第94-95页
   ·实验方法第95-97页
     ·大肠杆菌JM110的相关操作第95页
     ·碱变性单链化处理方法第95页
     ·转化原生质体的重组质粒准备第95-96页
     ·小量快速提取链霉菌总DNA第96页
     ·扩增长片段PCR反应体系第96-97页
     ·发酵液LC-MS分析第97页
     ·标准曲线的绘制第97页
     ·发酵条件单因素实验方法第97页
   ·实验结果第97-109页
     ·重组质粒的构建第97-101页
     ·重组质粒转化SIPI-1482原生质体第101-102页
     ·转化子的筛选第102页
     ·转化子的验证第102-105页
     ·各转化子发酵产物定性分析第105-106页
     ·1482(pYG816-4)发酵产物LC-MS分析第106页
     ·表柔红霉素标准曲线的绘制第106页
     ·工程菌1482(pYG816-4)发酵条件及发酵液后处理的初步研究第106-109页
     ·工程菌1482(pYG816-4)稳定性研究第109页
   ·实验讨论第109-110页
   ·结论第110-112页
总结及创新点第112-113页
参考文献第113-118页
发表文章及申请专利第118-119页
致谢第119-120页
附录第120-138页

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