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瘤胃微生物Real Time PCR定量方法的建立及其应用

第一章 文献综述第1-30页
 1 瘤胃微生物的主要种类第11页
 2 瘤胃微生物对动物生产和健康的影响第11-14页
  2.1 瘤胃微生物对动物生产的影响第11-13页
  2.2 瘤胃微生物对动物健康的影响第13-14页
 3 瘤胃微生物的定量方法第14-19页
  3.1 传统定量方法第14-15页
  3.2 分子定量方法第15-17页
  3.3 分子定量方法中的靶核酸片段第17页
  3.4 瘤胃微生物评价方法的发展趋势第17-19页
 4 Real Time PCR研究进展第19-22页
  4.1 定量原理第19页
  4.2 荧光标记的种类第19-21页
  4.3 定量方法第21-22页
  4.4 Real Time PCR的应用第22页
 5 反刍动物甲烷生成的机理与调控第22-28页
  5.1 甲烷生成的生物学机理第23-26页
  5.2 甲烷生成的调控第26-28页
 6 研究目的、意义及主要内容第28-30页
第二章 瘤胃微生物Real Time PCR定量方法的建立第30-95页
 1 前言第30页
 2 材料和方法第30-58页
  2.1 材料第30-37页
  2.2 方法第37-58页
 3 结果与分析第58-88页
  3.1 瘤胃微生物总DNA的提取与纯化第58-62页
  3.2 M.formicicum目标片段的克隆测序第62-65页
  3.3 M.formicicum Real time PCR反应条件的优化第65-67页
  3.4 M.formicicum 16S rDNA拷贝数的确定第67-69页
  3.5 M.formicicum 16S rDNA Real Time PCR标准曲线的制作第69-70页
  3.6 样品中M.formicicum的定量第70-72页
  3.7 M.mazei Internal Transcribed Spacer目标片段的克隆测序第72-75页
  3.8 M.mazei Real Time PCR反应体系的建立第75-76页
  3.9 M.mazei标准曲线的制作第76-78页
  3.10 总产甲烷菌的Real time PCR定量方法的建立第78-82页
  3.11 瘤胃Ciliate Protozoa Real time PCR相对定量方法的建立第82-83页
  3.12 瘤胃Butyrivibrio fibrisolven的相对定量方法的建立第83-84页
  3.13 瘤胃Ruminococcus albus的相对定量方法的建立第84-85页
  3.14 瘤胃中产甲烷菌的定量第85-88页
 4 讨论第88-94页
  4.1 瘤胃微生物Real time PCR定量方法的建立第88-92页
  4.2 Real time PCR在瘤胃微生物定量评价中的应用前景第92-94页
 5 小结第94-95页
第三章 日粮中添加植物油对反刍动物甲烷产量和瘤胃微生物数量的影响第95-113页
 1 前言第95页
 2 材料和方法第95-100页
  2.1 材料第95-97页
  2.2 方法第97-100页
 3 结果与分析第100-108页
  3.1 植物油对甲烷产量的影响第100-101页
  3.2 植物油对M.formicium数量的影响第101-102页
  3.3 植物油对总产甲烷菌数量的影响第102-103页
  3.4 植物油对纤毛虫数量的影响第103-104页
  3.5 植物油对及B.fibrivolen数量的影响第104-105页
  3.6 植物油对R.ablus数量的影响第105-108页
 4 讨论第108-112页
  4.1 日粮中添加植物油对瘤胃中甲烷产量和产甲烷菌的影响第108-109页
  4.2 日粮中添加植物油对瘤胃中Ciliate protozoa数量的影响第109页
  4.3 日粮中添加植物油对瘤胃中B.fibrivolen和R.ablus数量的影响第109-110页
  4.4 反刍动物日粮中添加植物油影响甲烷产量机制的探讨第110-111页
  4.5 人工瘤胃模拟实验的可行性与局限性第111-112页
 5 小结第112-113页
第四章 论文总体结论、创新点及需进一步研究的问题第113-115页
 1 结论第113页
 2 创新点第113-114页
 3 有待进一步研究的问题第114-115页
参考文献第115-126页
附录1 M. formicicum设计Real Time PCR引物的种内完全保守序列第126页
附录2 M. formicicum Real Time PCR预计扩增产物的相似性比较第126-127页
附录3 确定M. formicicum 16S rDNA拷贝数的杂交探针序列第127页
附录4 M. mazei克隆片段的测序结果第127-128页
附录5 M. mazei Real Time PCR引物序列的相似性比较第128-131页
致谢第131-132页
作者简历第132页

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