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基于PCR-DGGE方法的餐厨垃圾堆肥微生物多样性分析

摘要第1-7页
Abstract第7-12页
第1章 绪论第12-46页
   ·餐厨垃圾特征及其危害第12-13页
     ·餐厨垃圾的特征第12页
     ·餐厨垃圾的危害第12-13页
   ·堆肥第13-18页
     ·堆肥原理第13-14页
     ·堆肥影响因素第14-16页
     ·堆肥评价指标第16页
     ·堆肥微生物及优势种群第16-18页
       ·细菌第16-17页
       ·放线菌第17页
       ·真菌第17-18页
   ·微生物多样性研究第18-22页
     ·微生物物种的多样性第18页
     ·微生物多样性的某些特征第18-20页
     ·微生物多样性研究方法第20-22页
   ·分子生物学方法在堆肥微生物多样性研究中的应用第22-39页
     ·研究样品的制备第23页
     ·堆肥微生物特征核酸的获取与分析第23-24页
     ·聚合酶链式反应(PCR)扩增第24-27页
       ·PCR 扩增反应条件第25-26页
       ·PCR 扩增反应条件及一般程序第26-27页
     ·基于PCR 的核酸技术第27-38页
       ·PCR-SSCP第27-31页
       ·PCR-RFLP/TRFLP第31-33页
       ·PCR-RAPD/ARAPD第33-36页
       ·PCR-DGGE 方法第36页
       ·定量PCR 技术第36-38页
     ·基于PCR 的测序技术第38页
     ·荧光原位杂交(FISH)第38-39页
   ·变性梯度凝胶电泳技术简介第39-43页
     ·DGGE 的基本原理第40页
     ·DGGE 在微生物生态学研究中的应用第40-42页
     ·DGGE 技术自身存在的缺陷第42-43页
       ·DGGE 技术所存在的缺陷第42页
       ·减少实验偏差的解决办法第42-43页
     ·DGGE 在微生物生态学中的应用前景第43页
   ·主要分子生物学方法的比较第43页
   ·利用分子生物学方法进行微生物群落分析的展望第43-44页
   ·本研究的立题背景及研究意义第44-46页
第2章 PCR-DGGE 技术分析餐厨垃圾堆肥中细菌种群结构第46-62页
   ·材料与方法第46-55页
     ·材料第46-48页
       ·实验设备第46-47页
       ·堆肥第47页
       ·样品的初处理第47-48页
     ·实验方法第48-55页
       ·参数测定第48-51页
       ·总DNA 的提取第51-52页
       ·DNA 的纯化第52-53页
       ·PCR 扩增第53页
       ·DGGE 分析第53-55页
       ·DGGE 图谱相似性(Cs)分析第55页
   ·结果与讨论第55-61页
     ·堆肥化过程中的参数变化第55-57页
     ·堆肥样品基因组总DNA 的提取与PCR 扩增第57-58页
     ·PCR 扩增第58页
     ·堆肥周期细菌种群DGGE 指纹图谱结果与Cs 值分析第58-61页
   ·结论第61-62页
第3章 餐厨垃圾堆肥高温阶段细菌种群结构及系统发育分析第62-72页
   ·材料与方法第62-65页
     ·材料第62页
       ·样品来源第62页
       ·样品的初处理第62页
     ·实验方法第62-65页
       ·总DNA 的提取与纯化第62-63页
       ·PCR 扩增第63-64页
       ·高温阶段嗜热细菌种群动态的DGGE 分析第64页
       ·高温阶段DGGE 图谱相似性(Cs)分析第64页
       ·优势条带测序分析第64-65页
       ·系统发育分析第65页
   ·结果与讨论第65-70页
     ·餐厨垃圾堆肥化第65页
     ·高温阶段堆肥样总DNA 的提取、纯化与 PCR 扩增第65-66页
     ·高温阶段堆肥样品DGGE 指纹图谱结果与Cs 值分析第66-68页
     ·嗜热细菌系统发育分析第68-70页
   ·结论第70-72页
第4章 PCR-DGGE 技术分析餐厨垃圾堆肥高温阶段真菌、放线菌种群结构第72-81页
   ·材料与方法第72-75页
     ·材料第72-73页
       ·样品来源第72页
       ·样品的初处理第72-73页
     ·实验方法第73-75页
       ·总DNA 的提取与纯化第73页
       ·真菌、放线菌特异性引物PCR 扩增第73-74页
       ·真菌、放线菌种群动态的DGGE 分析第74-75页
       ·真菌、放线菌DGGE 图谱相似性(Cs)分析第75页
   ·结果与讨论第75-79页
     ·堆肥样总DNA 的提取、纯化第75页
     ·真菌、放线菌特异性引物PCR 扩增第75-76页
     ·堆肥样真菌、放线菌DGGE 图谱结果与Cs 值分析第76-79页
   ·结论第79-81页
结论第81-83页
参考文献第83-92页
致谢第92-93页
附录 A 攻读学位期间发表论文第93页

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