黄须伊乐寄蝇线粒体全基因组测定及其在双翅目系统发育推论中的应用
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 附注 | 第6-9页 |
| 第一章 引言 | 第9-13页 |
| ·线粒体基因组 | 第9-10页 |
| ·线粒体基因组的基本特征 | 第9页 |
| ·线粒体基因组的基本结构 | 第9-10页 |
| ·线粒体基因组在分子系统学研究中的优点 | 第10页 |
| ·双翅目线粒体基因组研究进展 | 第10-11页 |
| ·线粒体基因组研究的主要方向 | 第10-11页 |
| ·双翅目线粒体全基因组研究现状 | 第11页 |
| ·研究的目的和意义 | 第11-13页 |
| ·本研究的重要意义 | 第11-12页 |
| ·本研究的主要目的 | 第12-13页 |
| 第二章 材料与方法 | 第13-21页 |
| ·实验的总体思路设计 | 第13-14页 |
| ·实验材料的收集及整理 | 第14页 |
| ·标本的采集、保存 | 第14页 |
| ·种类鉴定、描述及照片 | 第14页 |
| ·主要实验仪器和试剂 | 第14-15页 |
| ·主要实验仪器 | 第14-15页 |
| ·主要实验试剂 | 第15页 |
| ·实验方法 | 第15-21页 |
| ·总 DNA 提取及保存 | 第15页 |
| ·线粒体基因组的引物设计 | 第15-18页 |
| ·线粒体基因组的扩增 | 第18-19页 |
| ·PCR 产物检测及测序 | 第19页 |
| ·序列的拼接注释及组成分分析 | 第19-20页 |
| ·系统发育分析 | 第20页 |
| ·起源分化时间的推测 | 第20-21页 |
| 第三章 黄须伊乐寄蝇线粒体基因组的测定及结构特征 | 第21-34页 |
| ·基因组总体结构及特征 | 第21-27页 |
| ·基因组结构 | 第21-23页 |
| ·基因顺序 | 第23页 |
| ·基因组碱基组成 | 第23-27页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第27-29页 |
| ·碱基组成及偏向性 | 第27-28页 |
| ·密码子使用情况 | 第28-29页 |
| ·tRNA 基因 | 第29-32页 |
| ·tRNA 基因基本特征 | 第29页 |
| ·tRNA 基因的二级结构预测 | 第29-32页 |
| ·rRNA 基因 | 第32页 |
| ·控制区（A+T 富含区） | 第32-33页 |
| ·基因间隔区及非编码区基因 | 第33-34页 |
| 第四章 基于线粒体基因的双翅目系统发育分析 | 第34-41页 |
| ·分析方法 | 第34-36页 |
| ·分类单元的选取 | 第34-35页 |
| ·数据筛选及分析模型选择 | 第35-36页 |
| ·系统发育树的构建 | 第36页 |
| ·最大似然法建树 | 第36页 |
| ·贝叶斯系统发育推论法建树 | 第36页 |
| ·结果分析 | 第36-41页 |
| 第五章 基于线粒体基因对寄蝇科昆虫起源时间的推测 | 第41-46页 |
| ·时间刻度的构建 | 第41-42页 |
| ·化石材料的收集 | 第41-42页 |
| ·时间刻度的选择 | 第42页 |
| ·起源分化时间的推测 | 第42-46页 |
| ·具有时间刻度的系统发育树的构建 | 第42页 |
| ·起源分化时间分析 | 第42-46页 |
| 结论 | 第46-48页 |
| 参考文献 | 第48-53页 |
| 附录 Ⅰ 黄须伊乐寄蝇的重新描述及该属的重新整理 | 第53-62页 |
| 附录 Ⅱ 本论文研究过程中发现的一新种 | 第62-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 个人简历 | 第66页 |
