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生物序列的索引研究及其应用

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-8页
第1章 引言第8-13页
   ·研究背景和意义第8-10页
     ·生物信息学第8-9页
     ·生物序列相似性查询第9-10页
   ·本文的主要工作第10-11页
   ·文章结构第11-13页
第2章 相关工作第13-21页
   ·问题定义及描述第13-17页
   ·研究进展第17-21页
第3章 BIOINDEX索引第21-27页
   ·索引的建立第21-22页
   ·基于BIOINDEX的查询算法第22-24页
   ·实验结果及其分析第24-26页
   ·本章小结第26-27页
第4章 SSQ_MF算法第27-46页
   ·最优过滤顺序模型和过滤集大小估计第27-38页
     ·最优过滤顺序模型第27-30页
     ·各过滤器的基本过滤原理第30-32页
     ·过滤集大小的在线估计第32-38页
   ·SSQ_MF算法实现策略第38-40页
   ·实验结果及其分析第40-45页
     ·参数影响第41-42页
     ·过滤水平第42-43页
     ·过滤代价和过滤准确度第43-45页
   ·本章小结第45-46页
第5章 转录调控序列数据挖掘系统第46-54页
   ·转录调控序列数据挖掘系统概述第46-48页
   ·顺式调控元件查询工具第48-49页
   ·转录调控序列挖掘工具第49-52页
     ·顺式调控元件挖掘工具第49-50页
     ·转录因子挖掘工具第50-52页
   ·本章小结第52-54页
第6章 总结与未来研究工作第54-56页
参考文献第56-61页
攻读硕士学位期间的工作成果第61-62页
致谢第62-63页

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