生物序列的索引研究及其应用
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第1章 引言 | 第8-13页 |
| ·研究背景和意义 | 第8-10页 |
| ·生物信息学 | 第8-9页 |
| ·生物序列相似性查询 | 第9-10页 |
| ·本文的主要工作 | 第10-11页 |
| ·文章结构 | 第11-13页 |
| 第2章 相关工作 | 第13-21页 |
| ·问题定义及描述 | 第13-17页 |
| ·研究进展 | 第17-21页 |
| 第3章 BIOINDEX索引 | 第21-27页 |
| ·索引的建立 | 第21-22页 |
| ·基于BIOINDEX的查询算法 | 第22-24页 |
| ·实验结果及其分析 | 第24-26页 |
| ·本章小结 | 第26-27页 |
| 第4章 SSQ_MF算法 | 第27-46页 |
| ·最优过滤顺序模型和过滤集大小估计 | 第27-38页 |
| ·最优过滤顺序模型 | 第27-30页 |
| ·各过滤器的基本过滤原理 | 第30-32页 |
| ·过滤集大小的在线估计 | 第32-38页 |
| ·SSQ_MF算法实现策略 | 第38-40页 |
| ·实验结果及其分析 | 第40-45页 |
| ·参数影响 | 第41-42页 |
| ·过滤水平 | 第42-43页 |
| ·过滤代价和过滤准确度 | 第43-45页 |
| ·本章小结 | 第45-46页 |
| 第5章 转录调控序列数据挖掘系统 | 第46-54页 |
| ·转录调控序列数据挖掘系统概述 | 第46-48页 |
| ·顺式调控元件查询工具 | 第48-49页 |
| ·转录调控序列挖掘工具 | 第49-52页 |
| ·顺式调控元件挖掘工具 | 第49-50页 |
| ·转录因子挖掘工具 | 第50-52页 |
| ·本章小结 | 第52-54页 |
| 第6章 总结与未来研究工作 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-61页 |
| 攻读硕士学位期间的工作成果 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |