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基于pulsed SILAC蛋白质组学定量方法的优化及其在microRNA靶基因筛选中的应用

缩略语第1-10页
摘要第10-12页
ABSTRACT第12-14页
第一章 前言第14-34页
 1 定量蛋白质组学技术的概况第14-22页
   ·基于二维凝胶电泳(2-DE)的蛋白质组学定量分析方法第14-16页
     ·传统的基于二维凝胶电泳(2-DE)的蛋白质组定量方法第14-15页
     ·基于双向差示荧光凝胶电泳技术的蛋白质组定量方法第15-16页
   ·基于质谱数据的定量分析方法第16-22页
     ·基于非标记策略的蛋白质组定量分析方法第16-17页
     ·基于稳定同位素标记的蛋白质组定量分析方法第17-22页
 2 神经胶质瘤的研究现状概述第22-24页
   ·神经胶质瘤的发病机制第22-23页
   ·MicroRNA 与神经胶质瘤第23-24页
 3 本课题的研究目的和意义第24-26页
 参考文献第26-34页
第二章 pSILAC 技术平台的建立和优化及其在筛选 miRNA-128 潜在靶基因中的应用第34-68页
 1 引言第34-35页
 2 材料与方法第35-40页
   ·主要试剂和仪器第35页
     ·主要试剂第35页
     ·仪器设备第35页
   ·pSILAC 标记方法的优化和平台的建立第35-37页
     ·pSILAC 标记方法的优化第35-36页
     ·优化后的 pSILAC 标记步骤第36-37页
   ·质谱检测第37-40页
     ·蛋白样品浓度测定第37-38页
     ·SDS-PAGE 分离蛋白及胶内酶切第38-39页
     ·液相分离与质谱鉴定第39-40页
   ·蛋白质鉴定和定量第40页
 3 结果与讨论第40-64页
   ·质谱鉴定和定量结果第40-46页
     ·定量准确性评价第40-42页
     ·定量结果第42-46页
   ·差异表达蛋白质的功能注释第46-50页
     ·表达量升高的蛋白质的 GO 分析第46-47页
     ·表达量降低的蛋白质的 GO 分析第47-50页
   ·MiR-128 在胶质瘤中作用靶基因的系统鉴定第50-63页
     ·差异蛋白的靶位点分析第50-51页
     ·预选 miR-128 靶基因 mRNA 水平的验证第51-52页
     ·预选 miR-128 靶基因的荧光素酶实验第52-54页
     ·预选靶基因蛋白的原始质谱结果第54-61页
     ·预选靶基因的功能分析第61-62页
     ·关于用质谱定量数据挑选靶基因的标准讨论第62-63页
   ·蛋白质相互作用网络的构建和关键调控节点的预测第63-64页
     ·蛋白质相互作用网络的构建第63页
     ·关键调控节点的预测及功能分析第63-64页
 4 小结第64-66页
 参考文献第66-68页
第三章 傅立叶变换离子回旋共振质谱数据采集方法的比较第68-75页
 1 实验部分第68-69页
   ·仪器与试剂第68页
   ·实验方法第68-69页
     ·标准蛋白酶切第68页
     ·酵母蛋白酶切第68-69页
     ·液相分离条件第69页
     ·质谱采集条件第69页
     ·数据检索第69页
 2 结果与讨论第69-72页
   ·数据依赖型串联质谱采集方法产生数据特点的比较第69-70页
   ·串联质谱采集时选择不同电荷离子作为母离子的比较第70-71页
   ·轮廓图和棒状图模式质谱数据的特点第71-72页
 3 结论第72-74页
 参考文献第74-75页
第四章 全文总结第75-76页
附录第76-118页
在读期间发表的研究论文及会议论文第118-119页
个人简历第119-120页
致谢第120页

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