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链霉菌催化芳香硝基还原及其关键酶的分离与克隆表达

摘要第1-6页
Abstract第6-14页
引言第14-15页
1 文献综述第15-46页
   ·生物催化芳香硝基还原研究进展第15-27页
     ·芳香硝基化合物的分布与危害第15-17页
     ·芳香硝基化合物的还原机理第17-19页
     ·生物体催化芳香硝基的还原第19-24页
     ·酶催化芳香硝基的还原第24-26页
     ·生物催化芳香硝基还原研究的趋势第26-27页
   ·芳香硝基还原酶第27-40页
     ·硝基还原酶的分类及特点第27-29页
     ·硝基还原酶的结构及催化机制第29-37页
     ·硝基还原酶的生物学功能第37-40页
   ·芳香硝基还原菌株的筛选及硝基还原酶的获取方法第40-44页
     ·芳香硝基还原菌株的筛选第40页
     ·硝基还原酶的获得第40-44页
   ·本论文的研究意义及内容第44-46页
2 高效还原芳香硝基链霉菌的筛选及鉴定第46-64页
   ·引言第46页
   ·实验材料与仪器第46-47页
     ·供试菌株第46-47页
     ·实验仪器第47页
     ·实验试剂第47页
   ·菌株筛选策略第47-48页
   ·实验方法第48-55页
     ·硝基还原分析方法的确定第48-50页
     ·供试培养基配方第50-51页
     ·菌体培养与收集第51页
     ·菌体全细胞转化底物4-硝基-1,8-萘酐第51页
     ·菌株的形态及培养特性观察第51-52页
     ·菌株的生理生化特性鉴定第52-53页
     ·菌株的16S rDNA序列测定与分析第53-55页
   ·实验结果第55-62页
     ·菌株的初筛及复筛第55页
     ·菌株的形态学观察第55-56页
     ·菌株的培养特性观察第56-57页
     ·菌株的生理生化特性第57页
     ·菌株的碳源利用情况第57-58页
     ·菌株的全细胞糖型和氨基酸分析第58-59页
     ·菌株16S rDNA的分子生物学分类鉴定第59-61页
     ·链霉菌及其它生物催化剂还原芳香硝基效率的比较第61-62页
   ·讨论第62-63页
   ·本章小结第63-64页
3 链霉菌高效还原芳香硝基的特性第64-78页
   ·引言第64页
   ·实验材料与仪器第64-65页
     ·供试菌株第64-65页
     ·实验仪器第65页
     ·实验试剂第65页
   ·实验方法第65-68页
     ·菌株初始培养温度和pH值的确定第65-66页
     ·碳源和氮源对链霉菌芳香硝基还原活性的影响第66页
     ·链霉菌还原芳香硝基的时间和浓度依赖性第66页
     ·助溶剂对链霉菌还原芳香硝基化合物的影响第66页
     ·链霉菌全细胞的海藻酸钙包埋第66-67页
     ·氧化还原介体辅助链霉菌还原芳香硝基化合物第67页
     ·链霉菌转化底物能力的驯化第67页
     ·链霉菌转化底物谱第67-68页
   ·实验结果第68-75页
     ·链霉菌初始培养温度和pH对转化率的影响第68页
     ·碳源和氮源对链霉菌还原芳香硝基化合物的影响第68-70页
     ·链霉菌还原芳香硝基的反应时间和底物浓度依赖性第70页
     ·助溶剂对链霉菌还原芳香硝基化合物的影响第70-72页
     ·菌株细胞的海藻酸钙包埋第72页
     ·氧化还原介体AQDS对链霉菌还原芳香硝基的辅助作用第72-73页
     ·链霉菌转化底物能力的驯化第73-74页
     ·链霉菌转化底物谱第74-75页
   ·讨论第75-77页
   ·本章小结第77-78页
4 链霉菌硝基还原酶的分离纯化及性质表征第78-104页
   ·引言第78-79页
   ·材料与仪器第79页
     ·实验材料第79页
     ·实验仪器第79页
   ·实验方法第79-86页
     ·菌体培养和细胞收集第79页
     ·粗酶液的获得第79-80页
     ·蛋白质浓度测定方法第80-81页
     ·硝基还原酶的检测方法第81页
     ·硝基还原酶分离纯化方法第81-83页
     ·纯化的硝基还原酶的SDS-PAGE电泳第83-84页
     ·纯化的硝基还原酶蛋白的N端测序第84-85页
     ·纯化的硝基还原酶蛋白的质谱鉴定第85页
     ·纯化的硝基还原酶的最适反应温度和pH值第85-86页
     ·纯化的硝基还原酶的动力学测定第86页
     ·影响硝基还原酶活性的因素考察第86页
   ·实验结果第86-101页
     ·硫酸铵沉淀蛋白第86-87页
     ·Sepharose G-25层析脱盐第87-88页
     ·Sepharose Q阴离子交换层析第88-89页
     ·Superdex 200凝胶过滤层析第89-90页
     ·硝基还原酶的聚丙烯酰胺凝胶电泳行为第90-91页
     ·分离的硝基还原酶N端序列比对分析第91-92页
     ·链霉菌硝基还原酶的质谱分析第92-93页
     ·温度对硝基还原酶活性的影响第93-94页
     ·pH值对硝基还原酶活性的影响第94页
     ·硝基还原酶的动力学表征第94-97页
     ·特异性抑制剂对硝基还原酶活性的影响第97-99页
     ·影响硝基还原酶活性因素的考察第99-101页
   ·讨论第101-102页
     ·硝基还原酶的分离纯化与鉴定第101页
     ·分离的链霉菌硝基还原酶与其它硝基还原酶的比较第101-102页
   ·本章小结第102-104页
5 链霉菌硝基还原酶的克隆表达及性质第104-129页
   ·引言第104-105页
   ·实验材料与仪器第105页
     ·供试菌株和质粒第105页
     ·实验仪器第105页
     ·实验试剂第105页
   ·实验方法第105-115页
     ·基因组DNA的提取第105-106页
     ·硝基还原酶基因的调取第106-107页
     ·硝基还原酶基因的测序第107页
     ·硝基还原酶基因及氨基酸序列分析及三级结构模拟第107-108页
     ·硝基还原酶基因表达载体的构建第108-110页
     ·硝基还原酶基因的无细胞系表达及活性检测第110页
     ·硝基还原酶基因转化大肠杆菌BL21(DE3)-pLysS第110-112页
     ·硝基还原酶基因在大肠杆菌BL21(DE3)-pLysS中的表达第112页
     ·重组硝基还原酶的活性检测第112-113页
     ·重组硝基还原酶的分离纯化第113页
     ·重组硝基还原酶的定量及SDS-PAGE分析第113页
     ·重组硝基还原酶的Western Blotting检测第113-114页
     ·重组硝基还原酶的native-PAGE活性染色第114页
     ·重组硝基还原酶的最适温度和pH值第114-115页
     ·金属离子及化合物对酶活性的影响第115页
     ·重组硝基还原酶的底物选择性第115页
   ·实验结果第115-127页
     ·链霉菌基因组DNA的提取第115-116页
     ·硝基还原酶基因的调取第116页
     ·硝基还原酶的基因和氨基酸序列分析第116-119页
     ·硝基还原酶基因表达载体的构建第119-120页
     ·硝基还原酶基因的无细胞系表达及活性检测第120-122页
     ·硝基还原酶基因在大肠杆菌中的表达产物的鉴定第122页
     ·重组硝基还原酶的分离纯化第122-123页
     ·重组硝基还原酶的SDS-PAGE及活性染色检测第123-124页
     ·重组硝基还原酶的最适温度和pH值第124-125页
     ·金属离子及化合物对重组硝基还原酶的影响第125-126页
     ·重组硝基还原酶底物谱第126-127页
   ·讨论第127-128页
   ·本章小结第128-129页
结论第129-131页
展望第131-132页
创新点摘要第132-133页
参考文献第133-141页
附录A 专有名词缩写第141-143页
附录B 常用仪器一览表第143-145页
附录C 常用试剂一览表第145-147页
附录D 两株链霉菌16S rDNA序列第147-149页
附录E 链霉菌硝基还原酶SNR的DNA和氨基酸序列第149-150页
攻读博士学位期间发表学术论文情况第150-151页
攻读博士学位期间专利申请情况第151-152页
致谢第152-153页
作者简介第153-155页

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