| 中文摘要 | 第3-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第一章 α-突触核蛋白错误折叠聚集机制及小分子抑制剂的分子动力学模拟研究进展 | 第14-43页 |
| 1.1 帕金森病概述 | 第14-15页 |
| 1.2 α-突触核蛋白与帕金森病 | 第15-27页 |
| 1.2.1 α-突触核蛋白 | 第15-19页 |
| 1.2.2 α-突触核蛋白的错误折叠与聚集 | 第19-21页 |
| 1.2.3 针对α-突触核蛋白的帕金森病治疗策略 | 第21-27页 |
| 1.3 α-突触核蛋白的分子模拟研究进展 | 第27-32页 |
| 1.3.1 单基因突变对α-突触核蛋白结构的影响 | 第27-28页 |
| 1.3.2 α-突触核蛋白二聚体低聚体形成过程及纤维化进程 | 第28-29页 |
| 1.3.3 α-突触核蛋白与其他淀粉样蛋白、突触核蛋白间的相互作用 | 第29-30页 |
| 1.3.4 α-突触核蛋白对质膜结构的影响 | 第30-31页 |
| 1.3.5 α-突触核蛋白分子模拟研究现状分析 | 第31-32页 |
| 1.4 分子动力学模拟 | 第32-41页 |
| 1.4.1 分子动力学模拟概述 | 第32-33页 |
| 1.4.2 力场 | 第33-34页 |
| 1.4.3 分子动力学模拟一般步骤 | 第34-35页 |
| 1.4.4 分子动力学模拟常规分析 | 第35-39页 |
| 1.4.5 加速分子动力学(AMD) | 第39-40页 |
| 1.4.6 拉伸分子动力学(SMD) | 第40-41页 |
| 1.5 本论文的选题思路及研究内容 | 第41-43页 |
| 第二章 核心肽段α-syn47-56在α-突触核蛋白五聚体模板诱导下聚集折叠机制的分子动力学模拟研究 | 第43-55页 |
| 2.1 研究背景 | 第43-44页 |
| 2.2 体系与方法 | 第44-46页 |
| 2.2.1 初始结构体系 | 第44-45页 |
| 2.2.2 分子动力学模拟 | 第45页 |
| 2.2.3 轨迹分析 | 第45-46页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第46-54页 |
| 2.3.1 α-突触核蛋白五聚体二体系的结构稳定性 | 第46-47页 |
| 2.3.2 肽段α-syn47-56在α-突触核蛋白五聚体的模板诱导下的整体结构变化 | 第47-49页 |
| 2.3.3 α-突触核蛋白五聚体对关键肽段α-syn47-56 的模板诱导机制分析 | 第49-54页 |
| 2.4 结论 | 第54-55页 |
| 第三章 E46K和 H50Q突变对α-突触核蛋白聚集体稳定性影响的加速分子动力学模拟研究 | 第55-67页 |
| 3.1 研究背景 | 第55页 |
| 3.2 研究方法 | 第55-57页 |
| 3.2.1 体系构建 | 第55-56页 |
| 3.2.2 加速分子动力学模拟 | 第56-57页 |
| 3.2.3 轨迹分析 | 第57页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第57-66页 |
| 3.3.1 α-突触核蛋白野生型和突变体E46K、H50Q的结构稳定性 | 第57-58页 |
| 3.3.2 E46K及 H50Q突变对α-突触核蛋白五聚体整体结构变化的影响 | 第58-62页 |
| 3.3.3 E46K及 H50Q突变对α-突触核蛋白五聚体结构影响的细节分析 | 第62-63页 |
| 3.3.4 E46K和 H50Q突变在关键区域α-syn44-57 引起的结构变化及相互作用变化分析 | 第63-66页 |
| 3.4 结论 | 第66-67页 |
| 第四章 α-突触核蛋白五聚体的解聚机制的拉伸分子动力学模拟研究 | 第67-75页 |
| 4.1 研究背景 | 第67页 |
| 4.2 体系与方法 | 第67-69页 |
| 4.2.1 初始结构 | 第67-68页 |
| 4.2.2 拉伸分子动力学模拟 | 第68页 |
| 4.2.3 轨迹分析 | 第68-69页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第69-74页 |
| 4.3.1 α-突触核蛋白五聚体主链稳定性 | 第69-70页 |
| 4.3.2 α-突触核蛋白五聚体在SMD模拟中边链的解聚过程 | 第70-71页 |
| 4.3.3 α-突触核蛋白五聚体边链解聚过程中残基间相互作用变化 | 第71-74页 |
| 4.4 结论 | 第74-75页 |
| 第五章 EGCG抑制α-突触核蛋白聚集机制的分子动力学模拟研究 | 第75-87页 |
| 5.1 研究背景 | 第75页 |
| 5.2 研究方法 | 第75-77页 |
| 5.2.1 初始纤维结构 | 第75-76页 |
| 5.2.2 分子动力学模拟 | 第76页 |
| 5.2.3 轨迹分析 | 第76-77页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第77-86页 |
| 5.3.1 α-突触核蛋白五聚体及十聚体体系的结构稳定性 | 第77-78页 |
| 5.3.2 α-突触核蛋白在小分子EGCG的诱导下整体结构变化 | 第78-82页 |
| 5.3.3 EGCG与 α-突触核蛋白纤维的结合作用机制 | 第82-86页 |
| 5.4 结论 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-110页 |
| 在学期间的研究成果 | 第110-112页 |
| 致谢 | 第112页 |
