| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 缩略词简表(Abbreviations) | 第11-16页 |
| 第一章 绪论 | 第16-26页 |
| 1.1 转录组的研究进展 | 第16页 |
| 1.1.1 转录组的概念 | 第16页 |
| 1.2 测序技术的发展 | 第16-18页 |
| 1.2.1 第一代测序技术 | 第16-17页 |
| 1.2.2 第二代测序技术 | 第17页 |
| 1.2.3 第三代测序技术 | 第17-18页 |
| 1.3 转录组测序在药用植物中作用 | 第18-19页 |
| 1.4 麦冬的研究现状 | 第19-24页 |
| 1.4.1 麦冬的生物学研究 | 第19页 |
| 1.4.2 麦冬化学成分 | 第19-20页 |
| 1.4.3 麦冬的药理作用 | 第20-23页 |
| 1.4.4 麦冬现代开发研究 | 第23页 |
| 1.4.5 麦冬分子生物学研究 | 第23-24页 |
| 1.5 课题研究背景、内容及意义 | 第24-26页 |
| 1.5.1 课题研究背景 | 第24-25页 |
| 1.5.2 研究内容与意义 | 第25-26页 |
| 第二章 不同年份浙麦冬转录组学研究 | 第26-52页 |
| 2.1 引言 | 第26页 |
| 2.2 实验材料 | 第26页 |
| 2.3 实验试剂和仪器 | 第26-27页 |
| 2.4 麦冬转录组测序建库 | 第27-30页 |
| 2.4.1 总RNA提取前准备 | 第27页 |
| 2.4.2 总RNA提取 | 第27-28页 |
| 2.4.3 分离mRNA | 第28-29页 |
| 2.4.4 文库构建 | 第29-30页 |
| 2.5 转录数据分析 | 第30-33页 |
| 2.5.1 数据过滤 | 第30-31页 |
| 2.5.2 数据组装 | 第31页 |
| 2.5.3 Unigene的注释和功能分类 | 第31-32页 |
| 2.5.4 基因表达差异分析 | 第32页 |
| 2.5.5 SSR分析 | 第32-33页 |
| 2.5.6 SNP和Indel分析 | 第33页 |
| 2.6 实验结果分析和讨论 | 第33-35页 |
| 2.6.1 RNA提取及质量检测 | 第33-35页 |
| 2.6.2 mRNA纯化和cDNA建库 | 第35页 |
| 2.7 生物信息学分析 | 第35-50页 |
| 2.7.1 测序结果分析 | 第35-37页 |
| 2.7.2 转录组序列功能注释 | 第37-39页 |
| 2.7.3 GO分类 | 第39-40页 |
| 2.7.4 KEGG通路分析 | 第40-43页 |
| 2.7.5 差异表达基因筛选 | 第43-46页 |
| 2.7.6 SSR分析 | 第46-48页 |
| 2.7.7 SNP-InDel分析 | 第48-50页 |
| 本章小结 | 第50-52页 |
| 第三章 浙麦冬甲基黄烷酮A、总黄酮、总皂苷和总多糖含量测定 | 第52-62页 |
| 3.1 引言 | 第52页 |
| 3.2 实验样本 | 第52页 |
| 3.3 实验试剂和仪器 | 第52-53页 |
| 3.4 不同年份麦冬块根药用成分含量的测定 | 第53-58页 |
| 3.4.1 提取前期形态学观察 | 第53页 |
| 3.4.2 麦冬甲基黄烷酮A含量测定 | 第53-54页 |
| 3.4.3 麦冬总黄酮含量测定 | 第54-55页 |
| 3.4.4 麦冬总皂苷含量测定 | 第55-57页 |
| 3.4.5 麦冬总多糖含量测定 | 第57-58页 |
| 3.5 结果分析和讨论 | 第58-61页 |
| 3.5.1 不年份浙麦冬甲基黄烷酮A的含量 | 第58页 |
| 3.5.2 不同年份浙麦冬总黄酮的含量 | 第58-59页 |
| 3.5.3 不同年份浙麦冬总皂苷的含量 | 第59-60页 |
| 3.5.4 不同年份浙麦冬总多糖的含量 | 第60-61页 |
| 本章小结 | 第61-62页 |
| 第四章 目的基因筛选及差异表达分析和RT-PCR验证 | 第62-75页 |
| 4.1 引言 | 第62页 |
| 4.2 实验样本 | 第62页 |
| 4.3 实验试剂和仪器 | 第62页 |
| 4.4 黄酮、皂苷和多糖合成通路分析相关基因挖掘 | 第62页 |
| 4.5 样本RT-PCR实验 | 第62-65页 |
| 4.5.1 引物设计 | 第63-64页 |
| 4.5.2 mRMA反转录cDNA | 第64页 |
| 4.5.3 SYBR实时荧光定量PCR | 第64-65页 |
| 4.5.4 数据分析 | 第65页 |
| 4.6 结果分析和讨论 | 第65-72页 |
| 4.6.1 黄酮化合物合成相关基因发掘及差异表达分析 | 第65-68页 |
| 4.6.2 皂苷类化合物合成相关基因发掘及差异表达分析 | 第68-70页 |
| 4.6.3 多糖合成相关基因发掘及差异表达分析 | 第70-72页 |
| 4.7 RT-qPCR实验验证 | 第72-73页 |
| 本章小结 | 第73-75页 |
| 总结与展望 | 第75-77页 |
| 参考文献 | 第77-85页 |
| 附录 | 第85-87页 |
