| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-22页 |
| 1 柑橘黄化脉明病毒简介 | 第12-16页 |
| 1.1 柑橘黄化脉明病毒的发生与分布 | 第12-13页 |
| 1.2 柑橘黄化脉明病毒的寄主与危害 | 第13页 |
| 1.3 柑橘黄化脉明病毒的传毒媒介与传毒方式 | 第13页 |
| 1.4 柑橘黄化脉明病毒的检测鉴定方法 | 第13-14页 |
| 1.5 柑橘黄化脉明病毒的基因组结构特征 | 第14页 |
| 1.6 柑橘黄化脉明病毒的防治 | 第14-16页 |
| 2 植物病毒遗传变异的研究进展 | 第16-19页 |
| 2.1 植物病毒种群遗传结构特征 | 第16-17页 |
| 2.2 植物病毒准种的遗传结构 | 第17-18页 |
| 2.3 植物病毒种群遗传结构分析方法 | 第18页 |
| 2.4 植物病毒遗传变异的研究意义 | 第18-19页 |
| 3 CYVCV的遗传变异研究进展 | 第19-20页 |
| 4 本研究的目的及意义 | 第20-22页 |
| 第二章 田间样品中CYVCV的RT-PCR检测 | 第22-32页 |
| 1 材料 | 第22-23页 |
| 1.1 毒源 | 第22页 |
| 1.2 酶及生化试剂 | 第22-23页 |
| 1.3 PCR引物 | 第23页 |
| 1.4 主要仪器 | 第23页 |
| 2 方法 | 第23-25页 |
| 2.1 植物总RNA提取 | 第23-24页 |
| 2.2 RT-PCR检测 | 第24-25页 |
| 2.2.1 cDNA合成 | 第24页 |
| 2.2.2 PCR反应体系 | 第24页 |
| 2.2.3 PCR程序 | 第24-25页 |
| 2.2.4 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第25页 |
| 3 结果与分析 | 第25-30页 |
| 3.1 我国4个省份的CYVCV检出情况 | 第25-27页 |
| 3.1.1 RNA质量检测结果 | 第25页 |
| 3.1.2 RT-PCR检测结果 | 第25-26页 |
| 3.1.3 CYVCV在各省不同寄主样品中的检出率 | 第26-27页 |
| 3.2 广西地区柑橘样品4种病毒的检出结果 | 第27-30页 |
| 3.2.1 广西地区样品中4种病毒的RT-PCR检测 | 第28-30页 |
| 3.2.2 广西地区样品中4种病毒的检出率 | 第30页 |
| 4 讨论 | 第30-32页 |
| 第三章 CYVCV的遗传多样性分析 | 第32-54页 |
| 1 材料 | 第32-33页 |
| 1.1 毒源 | 第32页 |
| 1.2 酶及生化试剂 | 第32-33页 |
| 1.3 常用仪器 | 第33页 |
| 2 方法 | 第33-40页 |
| 2.1 植物总RNA提取 | 第33页 |
| 2.2 RT-PCR反应 | 第33-34页 |
| 2.2.1 引物设计与合成 | 第33页 |
| 2.2.2 反转录合成cDNA | 第33-34页 |
| 2.2.3 PCR反应 | 第34页 |
| 2.2.4 PCR反应参数的设置 | 第34页 |
| 2.2.5 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第34页 |
| 2.3 RT-PCR产物的纯化回收 | 第34-35页 |
| 2.4 分子克隆 | 第35-37页 |
| 2.4.1 目的片段与T载体连接 | 第35页 |
| 2.4.2 质粒转化 | 第35-36页 |
| 2.4.3 重组质粒的提取与鉴定 | 第36-37页 |
| 2.5 序列测定与分析 | 第37-40页 |
| 3 结果与分析 | 第40-51页 |
| 3.1 CYVCV全基因组的扩增 | 第40页 |
| 3.2 CYVCV遗传结构分析 | 第40-43页 |
| 3.3 CYVCV重组分析 | 第43-46页 |
| 3.4 CYVCV各分离物全基因组及不同编码区的遗传多样性分析 | 第46-49页 |
| 3.5 CYVCV群体动态分析 | 第49-50页 |
| 3.6 CYVCV变异与进化分析 | 第50-51页 |
| 4 讨论 | 第51-54页 |
| 第四章 CYVCV不同基因种群结构及变异 | 第54-72页 |
| 1 材料 | 第54页 |
| 1.1 毒源 | 第54页 |
| 1.2 酶及生化试剂 | 第54页 |
| 1.3 常用仪器 | 第54页 |
| 2 方法 | 第54-58页 |
| 2.1 植物总RNA的提取 | 第54-55页 |
| 2.2 RT-PCR技术 | 第55-56页 |
| 2.2.1 反转录合成第一条链cDNA | 第55页 |
| 2.2.2 引物设计与合成 | 第55页 |
| 2.2.3 PCR反应 | 第55-56页 |
| 2.2.4 PCR反应参数的设置 | 第56页 |
| 2.3 RT-PCR产物的纯化回收 | 第56-57页 |
| 2.4 分子克隆技术 | 第57-58页 |
| 2.4.1 目的片段与T载体的连接 | 第57页 |
| 2.4.2 质粒转化 | 第57页 |
| 2.4.3 CYVCV种群的建立 | 第57-58页 |
| 2.5 序列测定与分析 | 第58页 |
| 3 结果与分析 | 第58-70页 |
| 3.1 CYVCV TGB自然种群结构及其变异分析 | 第58-61页 |
| 3.1.1 CYVCV TGB自然种群结构和变异水平 | 第58-60页 |
| 3.1.2 CYVCV TGB自然种群的变异特点 | 第60-61页 |
| 3.2 CYVCV CP自然种群结构及其变异分析 | 第61-65页 |
| 3.2.1 CYVCV CP自然种群结构和变异水平 | 第62-64页 |
| 3.2.2 CYVCV CP自然种群的变异特点 | 第64-65页 |
| 3.3 CYVCV P23自然种群结构及其变异分析 | 第65-70页 |
| 3.3.1 CYVCV P23自然种群结构和变异水平 | 第66-68页 |
| 3.3.2 CYVCV P23自然种群的变异特点 | 第68-70页 |
| 4 讨论 | 第70-72页 |
| 第五章 结论与展望 | 第72-74页 |
| 1 结论 | 第72页 |
| 2 展望 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-82页 |
| 附录 | 第82-84页 |
| 附录 A 本论文中所用缩写词及中英文对照 | 第82-83页 |
| 附录 B 常用生化及分子生物学试剂与仪器 | 第83-84页 |
| 致谢 | 第84页 |
