| 摘要 | 第5-6页 |
| Absrtact | 第6页 |
| 第一章 绪论 | 第9-10页 |
| 1.1 生物信息学的研究历史、发展情况 | 第9页 |
| 1.2 本文的主要工作 | 第9-10页 |
| 第二章 生物序列的比较 | 第10-24页 |
| 2.1 比对方法 | 第10-13页 |
| 2.1.1 Needleman-Wunsch算法 | 第10-11页 |
| 2.1.2 Smith-Waterman算法 | 第11-12页 |
| 2.1.3 其他比对方法 | 第12-13页 |
| 2.2 非比对方法 | 第13-23页 |
| 2.2.1 生物序列的图形表示 | 第13-19页 |
| 2.2.2 LZ复杂度算法 | 第19-22页 |
| 2.2.3 其他非比对方法 | 第22-23页 |
| 本章小结 | 第23-24页 |
| 第三章 进化树的构建 | 第24-28页 |
| 3.1 基于距离的方法 | 第24-25页 |
| 3.2 基于特征的方法 | 第25-27页 |
| 3.2.1 最大似然法 | 第25-26页 |
| 3.2.2 最大简约法 | 第26页 |
| 3.2.3 模糊聚类法 | 第26页 |
| 3.2.4 核方法 | 第26-27页 |
| 3.3 基于信息的方法 | 第27页 |
| 本章小结 | 第27-28页 |
| 第四章 进化树构建实例 | 第28-34页 |
| 4.1 实验方法 | 第28-29页 |
| 4.2 实验数据 | 第29-32页 |
| 4.2.1 Eutherian mammals序列 | 第29-30页 |
| 4.2.2 Hepatitis E virus(HEV)序列 | 第30-32页 |
| 4.3 实验验证 | 第32页 |
| 4.4 结果分析 | 第32-33页 |
| 本章小结 | 第33-34页 |
| 结论 | 第34-35页 |
| 参考文献 | 第35-38页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第38-39页 |
| 致谢 | 第39页 |