| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 概述 | 第10-20页 |
| 1.1 生物信息学的相关介绍 | 第10-14页 |
| 1.1.1 生物信息学的发展历程及其定义 | 第10-11页 |
| 1.1.2 生物信息学的研究内容 | 第11-13页 |
| 1.1.3 生物数据库的介绍 | 第13-14页 |
| 1.1.4 生物信息学的发展阶段 | 第14页 |
| 1.2 进化树的相关介绍 | 第14-18页 |
| 1.2.1 进化树的概念 | 第14-15页 |
| 1.2.2 进化树的研究意义 | 第15-16页 |
| 1.2.3 进化树的构建方法 | 第16-17页 |
| 1.2.4 构建进化树的软件 | 第17-18页 |
| 1.3 课题背景 | 第18页 |
| 1.4 国内外研究概况 | 第18-19页 |
| 1.5 本文主要研究工作 | 第19-20页 |
| 第二章 利用cvtree方法构建甲型流感病毒序列的进化树 | 第20-23页 |
| 2.1 引言 | 第20页 |
| 2.2 cvtree方法简述 | 第20页 |
| 2.3 数据来源 | 第20-21页 |
| 2.4 进化树的构建 | 第21页 |
| 2.5 结果与分析 | 第21-22页 |
| 2.6 小结 | 第22-23页 |
| 第三章 利用cvtree方法与复杂网络理论构建癌症进化树 | 第23-32页 |
| 3.1 引言 | 第23页 |
| 3.2 材料与方法 | 第23-25页 |
| 3.2.1 基因序列来源 | 第23-24页 |
| 3.2.2 网络的构建 | 第24页 |
| 3.2.3 网络的主要参数 | 第24-25页 |
| 3.2.4 进化树的构建方法 | 第25页 |
| 3.3 结果与分析 | 第25-30页 |
| 3.3.1 K值为6时的结果分析 | 第27-28页 |
| 3.3.2 K值为9时的结果分析 | 第28-29页 |
| 3.3.3 K值为12时的结果分析 | 第29页 |
| 3.3.4 K值为15时的结果分析 | 第29-30页 |
| 3.3.5 K值为18时的结果分析 | 第30页 |
| 3.4 小结 | 第30-32页 |
| 第四章 利用团簇法与复杂网络理论构建癌症进化树 | 第32-40页 |
| 4.1 引言 | 第32页 |
| 4.2 团簇法数学模型 | 第32-33页 |
| 4.3 网络的构建 | 第33页 |
| 4.4 构建进化树的方法 | 第33-34页 |
| 4.5 结果与分析 | 第34-39页 |
| 4.5.1 K值为6时的结果分析 | 第36页 |
| 4.5.2 K值为9时的结果分析 | 第36-37页 |
| 4.5.3 K值为12时的结果分析 | 第37页 |
| 4.5.4 K值为15时的结果分析 | 第37-38页 |
| 4.5.5 K值为18时的结果分析 | 第38-39页 |
| 4.6 小结 | 第39-40页 |
| 第五章 两种类型的62组tRNA密码子序列的进化树比较 | 第40-49页 |
| 5.1 引言 | 第40-41页 |
| 5.2 材料和方法 | 第41-43页 |
| 5.2.1 实验数据 | 第41-42页 |
| 5.2.2 tRNA网络的构建 | 第42页 |
| 5.2.3 进化树的构建 | 第42-43页 |
| 5.3 结果 | 第43-48页 |
| 5.4 小结 | 第48-49页 |
| 第六章 总结与展望 | 第49-52页 |
| 6.1 总结 | 第49-51页 |
| 6.2 展望 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第59页 |
