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氧化还原酶辅因子使用偏好的生物信息学与化学信息学研究

摘要第1-4页
ABSTRACT第4-5页
缩略词第5-7页
目录第7-9页
第一章 引言第9-15页
   ·氧化还原酶简介第9-10页
   ·辅因子简介第10-11页
   ·生物信息学简介第11-12页
   ·化学信息学简介第12-13页
   ·本论文的出发点和研究内容第13-15页
     ·本论文的出发点第13页
     ·本论文的研究内容第13-15页
第二章 氧化还原酶辅因子使用偏好的生物信息学研究第15-18页
   ·研究的对象第15页
   ·本章使用的相关生物信息数据库第15页
   ·研究方法及路线第15-17页
   ·结果与讨论第17页
   ·结论第17-18页
第三章 氧化还原酶辅因子使用偏好的进化生物学研究第18-29页
   ·本章使用的相关生物信息数据库第18页
   ·研究的对象第18-20页
   ·研究方法及路线第20-21页
     ·数据收集第20-21页
     ·数据处理第21页
     ·统计41个物种所使用的氧化还原酶辅因子第21页
   ·结果与讨论第21-27页
   ·结论第27-29页
第四章 氧化还原酶辅因子使用偏好的化学信息学研究第29-43页
   ·本章使用的化学信息学研究方法第29-30页
     ·分子描述符第29页
     ·主成分分析第29-30页
     ·化学空间第30页
   ·本章研究对象第30-31页
   ·本章使用的生物信息数据库、设备和软件简介第31-32页
     ·生物信息数据库介绍第31页
     ·硬件设备和计算软件第31-32页
   ·研究方法及路线第32-34页
     ·参与氧化还原酶反应的小分子的统计第32页
     ·分子描述符的计算第32-33页
     ·主反应对(main pair)的选取第33-34页
   ·结果和分析第34-41页
     ·小分子统计结果第34页
     ·金属酶组和有机酶组小分子描述符的计算结果与分析第34-35页
     ·金属酶组和有机酶组小分子描述符的柱状图第35-40页
     ·关于表征分子疏水指标的5个描述符的主成分分析和化学空间比较第40-41页
   ·结论第41-43页
第五章 论文总结第43-44页
参考文献第44-48页
附录第48-49页
 附表1 41个物种体内氧化还原酶及使用的辅因子第48页
 附表2 参与有机酶和金属酶氧化还原反应的小分子描述符计算结果第48页
 附表3 表征分子疏水性的描述符的主成分分析计算结果第48-49页
攻读硕士期间发表的论文第49-50页
致谢第50页

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