海带EST-SSR标记的开发及其遗传多样性研究
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 引言 | 第12-14页 |
| 1 文献综述 | 第14-33页 |
| 1.1 海带生物学特征 | 第14-20页 |
| 1.1.1 海带的分类地位与地理分布 | 第14页 |
| 1.1.2 海带的形态与结构 | 第14-16页 |
| 1.1.3 生活史与繁殖方式 | 第16-17页 |
| 1.1.4 海带孢子体生长发育与环境因子的关系 | 第17-18页 |
| 1.1.5 海带的营养价值与经济效益 | 第18-19页 |
| 1.1.6 海带的遗传育种现状 | 第19-20页 |
| 1.2 遗传多样性和遗传标记 | 第20-28页 |
| 1.2.1 DNA分子标记技术概述 | 第21-22页 |
| 1.2.2 微卫星标记 | 第22-24页 |
| 1.2.3 微卫星标记技术的特点 | 第24页 |
| 1.2.4 微卫星标记技术的应用 | 第24-25页 |
| 1.2.5 大型海藻中微卫星的主要类型 | 第25页 |
| 1.2.6 微卫星在海带中的研究现状 | 第25-26页 |
| 1.2.7 微卫星在其他藻类中的应用 | 第26-28页 |
| 1.3 微卫星的筛选方法 | 第28-29页 |
| 1.3.1 基因组文库法 | 第28页 |
| 1.3.2 公共数据库搜索微卫星序列 | 第28-29页 |
| 1.4 基于连锁不平衡的关联分析 | 第29-31页 |
| 1.4.1 关联分析的相关概念 | 第29页 |
| 1.4.2 关联分析的基本策略 | 第29-30页 |
| 1.4.3 关联分析的步骤 | 第30页 |
| 1.4.4 植物关联分析的研究进展 | 第30-31页 |
| 1.5 论文研究的目的和意义 | 第31-33页 |
| 2 海带微卫星标记的开发与应用 | 第33-49页 |
| 2.1 实验材料及实验仪器 | 第33-35页 |
| 2.1.1 实验材料来源及相关信息 | 第33页 |
| 2.1.2 主要试剂及其配制 | 第33-35页 |
| 2.1.3 实验材料的取用和预处理 | 第35页 |
| 2.2 主要实验仪器及试剂 | 第35-36页 |
| 2.3 实验方法 | 第36-44页 |
| 2.3.1 海带DNA的提取步骤 | 第36-37页 |
| 2.3.2 DNA的提取纯化及浓度测定 | 第37-38页 |
| 2.3.3 PCR反应及注意事项 | 第38-39页 |
| 2.3.4 PCR扩增体系的优化 | 第39-41页 |
| 2.3.5 聚丙烯酰胺凝胶电泳技术 | 第41-44页 |
| 2.4 实验结果及数据统计分析 | 第44-49页 |
| 2.4.1 微卫星引物设的设计 | 第44-45页 |
| 2.4.2 微卫星引物多态性的筛选 | 第45-46页 |
| 2.4.3 引物筛选结果 | 第46-49页 |
| 3 遗传多样性研究 | 第49-56页 |
| 3.1 数据分析方法 | 第49页 |
| 3.2 结果与分析 | 第49-56页 |
| 3.2.1 遗传多样性相关参数 | 第49页 |
| 3.2.2 遗传距离聚类 | 第49-51页 |
| 3.2.3 群体遗传结构分析 | 第51-52页 |
| 3.2.4 各种群之间的遗传关系 | 第52-53页 |
| 3.2.5 各种群之间的遗传多样性 | 第53-54页 |
| 3.2.6 海带遗传基础解析 | 第54-56页 |
| 4 关联分析与单标记分析 | 第56-63页 |
| 4.1 海带数量性状测量方法 | 第56页 |
| 4.2 海带数量性状在10个群体中的分布 | 第56-57页 |
| 4.3 关联分析结果 | 第57-59页 |
| 4.4 单标记分析结果 | 第59页 |
| 4.5 大群体验证性状关联标记 | 第59-63页 |
| 4.5.1 大群体验证实验 | 第59-62页 |
| 4.5.2 大群体验证实验结果 | 第62-63页 |
| 5 讨论 | 第63-66页 |
| 5.1 海带微卫星的开发 | 第63页 |
| 5.2 海带群体遗传结构分析 | 第63页 |
| 5.3 关联分析 | 第63-66页 |
| 5.3.1 两种计算模型结果的比较 | 第63-64页 |
| 5.3.2 影响关联分析结果的因素 | 第64页 |
| 5.3.3 两种不同模型结果的比较 | 第64-66页 |
| 6 小结 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-73页 |
| 附录 | 第73-84页 |
| 致谢 | 第84-86页 |
| 个人简历 | 第86-87页 |
