内容摘要 | 第6-7页 |
Abstract | 第7页 |
第一章 引言 | 第13-22页 |
1 癌症及癌症基因组图谱 | 第13页 |
2 TMB的定义与来源 | 第13-15页 |
2.1 TMB检测手段 | 第14页 |
2.2 TMB免疫响应原理 | 第14页 |
2.3 影响TMB大小的因素 | 第14-15页 |
3 肿瘤免疫循环和肿瘤免疫细胞浸润 | 第15-16页 |
3.1 肿瘤免疫循环 | 第15-16页 |
3.2 肿瘤免疫细胞浸润 | 第16页 |
4 相关研究进展 | 第16-19页 |
4.1 TMB研究进展 | 第16-17页 |
4.2 肿瘤微环境研究进展 | 第17-18页 |
4.3 肿瘤无病生存研究进展 | 第18页 |
4.4 突变积累和免疫综合作用的研究 | 第18-19页 |
5 工具与方法 | 第19-20页 |
5.1 无疾病进展生存分析 | 第19页 |
5.2 Limma工具包 | 第19-20页 |
5.3 WebGestalt网站工具 | 第20页 |
6 研究目的及研究内容 | 第20-22页 |
第二章 数据获取与数据整合 | 第22-26页 |
1 数据来源及数据信息 | 第22页 |
2 肿瘤样本质量控制 | 第22页 |
3 生物学指标计算 | 第22-23页 |
3.1 样本TMB计算 | 第22-23页 |
3.2 免疫细胞相对丰度计算 | 第23页 |
3.3 免疫反应活性计算 | 第23页 |
4 样本TMB积累程度的计算 | 第23-26页 |
第三章 免疫反应活性比值模型的构建及应用 | 第26-36页 |
1 免疫反应活性比值模型构建 | 第26页 |
2 免疫反应活性预处理 | 第26-27页 |
3 无病生存分析 | 第27-29页 |
3.1 LIHC无病生存分析 | 第27-28页 |
3.2 THCA无病生存分析 | 第28-29页 |
4 差异表达及基因功能富集分析 | 第29-34页 |
4.1 LIHC差异表达及基因功能富集分析 | 第30-31页 |
4.2 THCA差异表达及基因功能富集分析 | 第31-34页 |
5 本章小结 | 第34-36页 |
第四章 构建基于免疫细胞相对丰度的无病生存预测模型 | 第36-45页 |
1 筛选与无病生存相关免疫细胞 | 第36-37页 |
2 免疫细胞相对丰度比值模型的构建 | 第37-38页 |
3 风险模型与临床信息关联 | 第38-39页 |
4 差异表达及基因功能富集分析 | 第39-43页 |
4.1 LIHC差异表达及基因功能富集分析 | 第40-41页 |
4.2 THCA差异表达及基因功能富集分析 | 第41-43页 |
5 本章小结 | 第43-45页 |
第五章 综合模型的构建及应用 | 第45-51页 |
1 免疫细胞、免疫反应和TMB综合作用模型构建 | 第45-46页 |
2 风险模型与临床信息关联 | 第46-47页 |
3 差异表达及基因功能富集分析 | 第47-50页 |
3.1 LIHC差异表达及基因功能富集分析 | 第48页 |
3.2 THCA差异表达及基因功能富集分析 | 第48-50页 |
4 本章小结 | 第50-51页 |
第六章 三类模型的比较和应用拓展 | 第51-56页 |
1 三类模型高低复发风险患者的比较 | 第51-52页 |
2 三类模型患者差异表达基因的比较 | 第52-54页 |
3 模型临床应用拓展 | 第54-56页 |
第七章 总结与展望 | 第56-58页 |
参考文献 | 第58-62页 |
附录 | 第62-105页 |
后记 | 第105页 |