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基于免疫和肿瘤突变负荷的癌症患者无病生存评估模型构建

内容摘要第6-7页
Abstract第7页
第一章 引言第13-22页
    1 癌症及癌症基因组图谱第13页
    2 TMB的定义与来源第13-15页
        2.1 TMB检测手段第14页
        2.2 TMB免疫响应原理第14页
        2.3 影响TMB大小的因素第14-15页
    3 肿瘤免疫循环和肿瘤免疫细胞浸润第15-16页
        3.1 肿瘤免疫循环第15-16页
        3.2 肿瘤免疫细胞浸润第16页
    4 相关研究进展第16-19页
        4.1 TMB研究进展第16-17页
        4.2 肿瘤微环境研究进展第17-18页
        4.3 肿瘤无病生存研究进展第18页
        4.4 突变积累和免疫综合作用的研究第18-19页
    5 工具与方法第19-20页
        5.1 无疾病进展生存分析第19页
        5.2 Limma工具包第19-20页
        5.3 WebGestalt网站工具第20页
    6 研究目的及研究内容第20-22页
第二章 数据获取与数据整合第22-26页
    1 数据来源及数据信息第22页
    2 肿瘤样本质量控制第22页
    3 生物学指标计算第22-23页
        3.1 样本TMB计算第22-23页
        3.2 免疫细胞相对丰度计算第23页
        3.3 免疫反应活性计算第23页
    4 样本TMB积累程度的计算第23-26页
第三章 免疫反应活性比值模型的构建及应用第26-36页
    1 免疫反应活性比值模型构建第26页
    2 免疫反应活性预处理第26-27页
    3 无病生存分析第27-29页
        3.1 LIHC无病生存分析第27-28页
        3.2 THCA无病生存分析第28-29页
    4 差异表达及基因功能富集分析第29-34页
        4.1 LIHC差异表达及基因功能富集分析第30-31页
        4.2 THCA差异表达及基因功能富集分析第31-34页
    5 本章小结第34-36页
第四章 构建基于免疫细胞相对丰度的无病生存预测模型第36-45页
    1 筛选与无病生存相关免疫细胞第36-37页
    2 免疫细胞相对丰度比值模型的构建第37-38页
    3 风险模型与临床信息关联第38-39页
    4 差异表达及基因功能富集分析第39-43页
        4.1 LIHC差异表达及基因功能富集分析第40-41页
        4.2 THCA差异表达及基因功能富集分析第41-43页
    5 本章小结第43-45页
第五章 综合模型的构建及应用第45-51页
    1 免疫细胞、免疫反应和TMB综合作用模型构建第45-46页
    2 风险模型与临床信息关联第46-47页
    3 差异表达及基因功能富集分析第47-50页
        3.1 LIHC差异表达及基因功能富集分析第48页
        3.2 THCA差异表达及基因功能富集分析第48-50页
    4 本章小结第50-51页
第六章 三类模型的比较和应用拓展第51-56页
    1 三类模型高低复发风险患者的比较第51-52页
    2 三类模型患者差异表达基因的比较第52-54页
    3 模型临床应用拓展第54-56页
第七章 总结与展望第56-58页
参考文献第58-62页
附录第62-105页
后记第105页

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