小鼠精子形成过程中同源重组位点的识别
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 前言 | 第11-13页 |
| 第一部分 小鼠单倍体精子细胞的分离 | 第13-18页 |
| 1.1 实验材料 | 第13-14页 |
| 1.1.1 研究对象 | 第13页 |
| 1.1.2 主要试剂和仪器 | 第13-14页 |
| 1.1.3 相关试剂配制方法 | 第14页 |
| 1.2 实验方法 | 第14-16页 |
| 1.2.1 小鼠杂交 | 第14-15页 |
| 1.2.2 小鼠精细胞获取 | 第15-16页 |
| 1.2.3 流式分选单倍体精子细胞 | 第16页 |
| 1.3 结果 | 第16-17页 |
| 1.3.1 流式细胞仪分选结果 | 第16-17页 |
| 1.4 讨论 | 第17-18页 |
| 1.4.1 小鼠精细胞获取 | 第17-18页 |
| 1.4.2 流式分选 | 第18页 |
| 第二部分 精子细胞DNA提取及长片段文库构建 | 第18-30页 |
| 2.1 实验材料 | 第18-21页 |
| 2.1.1 主要试剂和仪器 | 第18-20页 |
| 2.1.2 相关试剂配制方法 | 第20-21页 |
| 2.2 实验方法 | 第21-26页 |
| 2.2.1 单倍体精子细胞DNA的提取 | 第21页 |
| 2.2.2 long-read DNA文库构建 | 第21-26页 |
| 2.3 结果 | 第26-29页 |
| 2.4 讨论 | 第29-30页 |
| 第三部分 长片段文库数据分析 | 第30-44页 |
| 3.1 高通量测序相关信息 | 第30页 |
| 3.2 测序数据分析过程 | 第30-32页 |
| 3.2.1 准备 | 第30页 |
| 3.2.2 Mapping工作 | 第30-31页 |
| 3.2.3 数据拆分 | 第31页 |
| 3.2.4 下载SNP数据 | 第31页 |
| 3.2.5 phasing分析 | 第31页 |
| 3.2.6 phasing处理后文件排序 | 第31页 |
| 3.2.7 分组后提取候选组 | 第31页 |
| 3.2.8 嵌合片段生物学功能相关性分析 | 第31-32页 |
| 3.3 数据分析 | 第32-42页 |
| 3.4 结果及讨论 | 第42-44页 |
| 小结 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-47页 |
| 综述 人类基因组学分析中相位分析的作用 | 第47-54页 |
| 参考文献 | 第51-54页 |
| 附录 | 第54-61页 |
| 附录 1 | 第54-59页 |
| 附录 2 | 第59-61页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
