| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 英文缩略表 | 第15-16页 |
| 第一章 绪论 | 第16-30页 |
| 1.1 狐概述 | 第16-17页 |
| 1.2 狐毛色的基因型遗传 | 第17-19页 |
| 1.3 狐皮肤和被毛形态结构 | 第19-22页 |
| 1.3.1 狐皮肤的组织结构 | 第19-21页 |
| 1.3.2 狐被毛的形态结构 | 第21-22页 |
| 1.4 毛色的分子遗传 | 第22-25页 |
| 1.4.1 色素合成和运输 | 第22-24页 |
| 1.4.2 毛色形成相关基因 | 第24页 |
| 1.4.3 毛色形成信号通路 | 第24-25页 |
| 1.5 转录组测序概述 | 第25-27页 |
| 1.5.1 转录组学 | 第25-26页 |
| 1.5.2 转录组测序研究存在的问题 | 第26-27页 |
| 1.6 MIRNA测序 | 第27-29页 |
| 1.6.1 miRNA概述 | 第27页 |
| 1.6.2 miRNA的形成机制 | 第27-28页 |
| 1.6.3 miRNA的应用 | 第28-29页 |
| 1.7 研究目的和意义 | 第29-30页 |
| 第二章 毛色差异的常规分析 | 第30-38页 |
| 2.1 引言 | 第30页 |
| 2.2 材料与方法 | 第30-33页 |
| 2.2.1 主要仪器和试剂 | 第30页 |
| 2.2.2 试验材料 | 第30-31页 |
| 2.2.3 狐皮肤常规HE组织切片 | 第31-32页 |
| 2.2.4 狐被毛的黑色素含量测定 | 第32页 |
| 2.2.5 狐染色体分析 | 第32-33页 |
| 2.3 结果与分析 | 第33-37页 |
| 2.3.1 狐皮肤的HE组织切片 | 第33页 |
| 2.3.2 狐被毛的色素含量 | 第33-35页 |
| 2.3.3 赤狐和银黑狐的染色体比较 | 第35-36页 |
| 2.3.4 分析和讨论 | 第36-37页 |
| 2.4 本章小结 | 第37-38页 |
| 第三章 RNA-SEQ和转录组学分析 | 第38-58页 |
| 3.1 引言 | 第38页 |
| 3.2 材料与方法 | 第38-42页 |
| 3.2.1 数据库及分析软件 | 第38页 |
| 3.2.2 主要仪器和试剂 | 第38-39页 |
| 3.2.3 组织样采集 | 第39页 |
| 3.2.4 总RNA提取 | 第39页 |
| 3.2.5 mRNA建库测序 | 第39-41页 |
| 3.2.6 生物信息分析流程 | 第41-42页 |
| 3.3 结果与分析 | 第42-56页 |
| 3.3.1 RNA提取检测 | 第42-43页 |
| 3.3.2 测序数据质量 | 第43-45页 |
| 3.3.3 转录本拼接 | 第45-46页 |
| 3.3.4 基因功能注释 | 第46-51页 |
| 3.3.5 差异表达基因分析 | 第51-53页 |
| 3.3.6 差异表达基因PTPRU的生物信息学分析 | 第53-56页 |
| 3.3.7 分析与讨论 | 第56页 |
| 3.4 本章小结 | 第56-58页 |
| 第四章 MIRNA高通量测序分析 | 第58-75页 |
| 4.1 引言 | 第58页 |
| 4.2 材料与方法 | 第58-60页 |
| 4.2.1 数据库及分析软件 | 第58页 |
| 4.2.2 主要仪器和试剂 | 第58页 |
| 4.2.3 试验样品 | 第58页 |
| 4.2.4 建库测序流程 | 第58-60页 |
| 4.2.5 miRNAs生物信息分析流程 | 第60页 |
| 4.3 结果与分析 | 第60-74页 |
| 4.3.1 测序数据质量评估 | 第60-64页 |
| 4.3.2 序列比对分析 | 第64-65页 |
| 4.3.3 已知miRNA分析 | 第65-66页 |
| 4.3.4 ncRNA分析 | 第66页 |
| 4.3.5 重复序列比对 | 第66-68页 |
| 4.3.6 新miRNA预测 | 第68-69页 |
| 4.3.7 sRNA分类统计 | 第69页 |
| 4.3.8 miRNA家族分析 | 第69页 |
| 4.3.9 miRNA表达及差异分析 | 第69-70页 |
| 4.3.10 miRNA靶基因预测 | 第70-71页 |
| 4.3.11 差异miRNA靶基因富集分析 | 第71-73页 |
| 4.3.12 分析与讨论 | 第73-74页 |
| 4.4 本章小结 | 第74-75页 |
| 第五章 色素基因的分子克隆及生物信息学分析 | 第75-91页 |
| 5.1 引言 | 第75-76页 |
| 5.1.1 MC1R基因概述 | 第75页 |
| 5.1.2 MITF基因概述 | 第75-76页 |
| 5.1.3 TYRP1基因概述 | 第76页 |
| 5.2 材料与方法 | 第76-80页 |
| 5.2.1 主要仪器和试剂 | 第76页 |
| 5.2.2 毛色候选基因的分子克隆 | 第76-79页 |
| 5.2.3 生物信息学分析 | 第79-80页 |
| 5.3 结果与分析 | 第80-90页 |
| 5.3.1 毛色基因RT-PCR产物电泳检测 | 第80-81页 |
| 5.3.2 毛色基因的序列信息分析 | 第81页 |
| 5.3.3 系统进化树构建 | 第81-83页 |
| 5.3.4 蛋白质的结构和功能分析 | 第83-90页 |
| 5.3.5 分析与讨论 | 第90页 |
| 5.4 本章小结 | 第90-91页 |
| 第六章 TYRP1在黑素细胞中的功能研究 | 第91-102页 |
| 6.1 引言 | 第91-93页 |
| 6.1.1 黑素细胞的分离培养 | 第91页 |
| 6.1.2 PiggyBac表达载体 | 第91-93页 |
| 6.2 材料与方法 | 第93-97页 |
| 6.2.1 主要仪器和试剂 | 第93-94页 |
| 6.2.2 试验材料 | 第94页 |
| 6.2.3 黑素细胞分离与培养 | 第94-95页 |
| 6.2.4 TYRP1-PiggyBac载体构建 | 第95-96页 |
| 6.2.5 TYRP1-PiggyBac质粒转染黑素细胞 | 第96页 |
| 6.2.6 色素测定 | 第96-97页 |
| 6.3 结果与分析 | 第97-101页 |
| 6.3.1 狐皮肤黑素细胞 | 第97-99页 |
| 6.3.2 TYRP1-PiggyBac载体双酶切鉴定 | 第99-100页 |
| 6.3.3 转染黑素细胞 | 第100页 |
| 6.3.4 单细胞色素含量 | 第100-101页 |
| 6.3.5 分析与讨论 | 第101页 |
| 6.4 本章小结 | 第101-102页 |
| 第七章 全文结论 | 第102-103页 |
| 参考文献 | 第103-108页 |
| 致谢 | 第108-109页 |
| 附录 | 第109-122页 |
| 第一章 绪论(彩图) | 第109-110页 |
| 第二章 毛色变异的生化分析(彩图) | 第110-112页 |
| 第三章 RNA-SEQ和转录组学分析(彩图) | 第112-116页 |
| 第四章 MIRNA高通量测序分析(彩图) | 第116-121页 |
| 第六章 TYRP1 在黑素细胞中的功能研究(彩图) | 第121-122页 |
| 作者简历 | 第122页 |
