| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 前言 | 第13-30页 |
| 1.1 黄单胞菌及其致病机理研究进展 | 第13-18页 |
| 1.1.1 黄单胞菌及其引起的植物病害 | 第13页 |
| 1.1.2 黄单胞菌基因组的研究进展 | 第13-15页 |
| 1.1.3 主要致病生化因子 | 第15-18页 |
| 1.2 双组份系统 | 第18-26页 |
| 1.2.1 双组份系统的组成 | 第18页 |
| 1.2.2 组氨酸激酶 | 第18-20页 |
| 1.2.3 反应调控子结构域 | 第20-21页 |
| 1.2.4 传递类型 | 第21-23页 |
| 1.2.5 双组份调控系统的功能 | 第23-24页 |
| 1.2.6 PhoB/PhoR系统 | 第24-26页 |
| 1.3 水稻细菌性条斑病及其致病菌 | 第26-28页 |
| 1.3.1 水稻细菌性条斑病菌的命名 | 第26页 |
| 1.3.2 水稻细菌性条斑病菌的分布 | 第26页 |
| 1.3.3 水稻细菌性条斑病菌引起病害的方式 | 第26-27页 |
| 1.3.4 水稻细菌性条斑病菌与水稻白叶枯病菌 | 第27-28页 |
| 1.3.5 Xoc GXO1的研究进展 | 第28页 |
| 1.4 本研究的主要内容、目的和意义 | 第28-30页 |
| 1.4.1 主要内容与目的 | 第28-29页 |
| 1.4.2 主要意义 | 第29-30页 |
| 第二章 材料与方法 | 第30-45页 |
| 2.1 实验材料 | 第30-35页 |
| 2.1.1 菌株与质粒 | 第30-31页 |
| 2.1.2 引物 | 第31-32页 |
| 2.1.3 抗生素 | 第32-33页 |
| 2.1.4 培养基 | 第33页 |
| 2.1.5 溶液与缓冲液 | 第33-35页 |
| 2.2 常规微生物学操作 | 第35-37页 |
| 2.2.1 菌株培养与菌种的保存 | 第35页 |
| 2.2.2 胞外多糖的检测 | 第35-36页 |
| 2.2.3 胞外蛋白酶的检测 | 第36页 |
| 2.2.4 游动性的检测 | 第36页 |
| 2.2.5 抗逆性的检测 | 第36页 |
| 2.2.6 丰富培养基中Xoc生长曲线的检测 | 第36-37页 |
| 2.3 核酸制备与质粒提取 | 第37-39页 |
| 2.3.1 Xoc GX01的DNA制备 | 第37页 |
| 2.3.2 Xoc GX01的RNA提取 | 第37-38页 |
| 2.3.3 RNA的消化与验证 | 第38页 |
| 2.3.4 cDNA的合成 | 第38-39页 |
| 2.3.5 质粒的提取 | 第39页 |
| 2.4 DNA的分子操作 | 第39-41页 |
| 2.4.1 DNA的纯化 | 第39-40页 |
| 2.4.2 DNA的酶切 | 第40页 |
| 2.4.3 DNA的连接 | 第40页 |
| 2.4.4 DNA的电泳 | 第40页 |
| 2.4.5 DNA的测序 | 第40-41页 |
| 2.5 聚合酶链式反应 | 第41页 |
| 2.5.1 引物设计及配制 | 第41页 |
| 2.5.2 PCR扩增的模板的制备 | 第41页 |
| 2.5.3 PCR反应体系与条件 | 第41页 |
| 2.6 细菌的转化与接合实验 | 第41-43页 |
| 2.6.1 感受态细胞的制备 | 第41-43页 |
| 2.6.2 三亲本接合实验 | 第43页 |
| 2.7 非极性整合突变体的构建与互补 | 第43-44页 |
| 2.7.1 非极性整合突变体的构建 | 第43-44页 |
| 2.7.2 互补株的构建 | 第44页 |
| 2.8 植株试验 | 第44-45页 |
| 2.8.1 植株材料与工具 | 第44页 |
| 2.8.2 致病力检测 | 第44页 |
| 2.8.3 过敏反应 | 第44-45页 |
| 第三章 结果与分析 | 第45-77页 |
| 3.1 候选基因的选择与生物信息学分析 | 第45-48页 |
| 3.1.1 Xoc GXO1中推测的双组份系统调控子基因 | 第45-46页 |
| 3.1.2 候选调控子基因在其他黄单胞菌中的分布 | 第46-47页 |
| 3.1.3 调控子蛋白质结构域的生物信息学分析 | 第47-48页 |
| 3.2 候选调控子基因的整合突变及表型分析 | 第48-52页 |
| 3.2.1 突变体的胞外多糖(EPS)检测 | 第48-49页 |
| 3.2.2 突变体的胞外蛋白酶检测 | 第49-50页 |
| 3.2.3 突变体的游动性检测 | 第50-51页 |
| 3.2.4 突变体的致病性检测 | 第51-52页 |
| 3.3 候选互补基因的选择及其特征 | 第52-57页 |
| 3.3.1 候选的互补基因及特征 | 第52页 |
| 3.3.2 XOC1021在基因组中的位置及上下游关系 | 第52-53页 |
| 3.3.3 XOC1021的生物信息学分析 | 第53-57页 |
| 3.4 XOC1021非极性整合突变体的构建 | 第57-60页 |
| 3.4.1 PCR扩增XOC1021的内部片段 | 第57-58页 |
| 3.4.2 重组质粒nK1021的构建 | 第58-60页 |
| 3.4.3 突变体NK1021的验证 | 第60页 |
| 3.5 NK1021的遗传互补 | 第60-64页 |
| 3.5.1 互补外源的扩增 | 第61-62页 |
| 3.5.2 重组质粒pLAFER3C1021的构建 | 第62-63页 |
| 3.5.3 互补菌株的PCR验证 | 第63-64页 |
| 3.5.4 PNK1021的构建与验证 | 第64页 |
| 3.6 突变体与互补菌株的生理生化特性分析 | 第64-75页 |
| 3.6.1 CNK1021与NK1021的生长情况检测 | 第64-66页 |
| 3.6.2 CNK1021与NK1021胞外多糖的检测 | 第66-67页 |
| 3.6.3 CNK1021与NK1021胞外蛋白酶的检测 | 第67-68页 |
| 3.6.4 CNK1021与NK1021游动性的检测 | 第68-69页 |
| 3.6.5 CNK1021与NK1021的抗逆性检测 | 第69-73页 |
| 3.6.6 CNK1021与NK1021的HR反应 | 第73-74页 |
| 3.6.7 CNK1021与NK1021的致病力检测 | 第74-75页 |
| 3.7 XOC1020与XOC1021的转录关系分析 | 第75-77页 |
| 第四章 总结与讨论 | 第77-80页 |
| 4.1 功能基因组学的研究方法 | 第77页 |
| 4.2 双组分系统中18个调控子在Xoc GXO1中推测的功能 | 第77-78页 |
| 4.3 Xoc GX01中phoB基因的功能 | 第78-79页 |
| 4.4 pLAFR3对突变体的影响 | 第79-80页 |
| 参考文献 | 第80-93页 |
| 致谢 | 第93-94页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第94页 |
