| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略词 | 第12-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-19页 |
| 1.1 粒重分子基础研究进展 | 第13-14页 |
| 1.2 含油量分子基础研究的现状 | 第14-15页 |
| 1.3 高通量测序技术 | 第15-18页 |
| 1.4 本研究的意义 | 第18-19页 |
| 第二章 材料和方法 | 第19-26页 |
| 2.1 实验仪器与试剂 | 第19页 |
| 2.2 油菜材料 | 第19页 |
| 2.3 总RNA的提取和检测 | 第19页 |
| 2.4 小RNA测序分析 | 第19-22页 |
| 2.4.1 文库构建和测序 | 第19-20页 |
| 2.4.2 测序原始数据预处理 | 第20页 |
| 2.4.3 已知miRNAs和新的miRNAs鉴定以及靶基因预测 | 第20页 |
| 2.4.4 miRNAs差异表达分析及聚类分析 | 第20-21页 |
| 2.4.5 miRNAs靶基因的功能注释及富集分析 | 第21-22页 |
| 2.5 降解组测序分析 | 第22页 |
| 2.5.1 获得目标片段和测序 | 第22页 |
| 2.5.2 测序数据的预处理及信息分析 | 第22页 |
| 2.6 实时荧光定量PCR验证测序结果 | 第22-26页 |
| 2.6.1 差异表达的已知miRNAs的荧光定量PCR验证 | 第22-24页 |
| 2.6.2 差异表达miRNAs的靶基因的荧光定量PCR验证 | 第24-26页 |
| 第三章 结果与分析 | 第26-46页 |
| 3.1 G-42 和 7-9 的粒重和含油量表型 | 第26页 |
| 3.2 粒重和含油量相关miRNAs分析及候选基因预测 | 第26-32页 |
| 3.2.1 小RNA测序质量分析 | 第26-29页 |
| 3.2.2 小RNA差异表达分析 | 第29-30页 |
| 3.2.3 差异表达miRNAs聚类分析 | 第30页 |
| 3.2.4 小RNA的靶基因预测 | 第30-32页 |
| 3.3 靶基因功能注释 | 第32-36页 |
| 3.3.1 靶基因注释 | 第32页 |
| 3.3.2 差异表达miRNAs靶基因的GO分类 | 第32页 |
| 3.3.3 差异表达miRNAs靶基因的COG注释 | 第32-34页 |
| 3.3.4 差异表达miRNAs靶基因KEGG注释及通路富集分析 | 第34-35页 |
| 3.3.5 控制粒重和含油量候选基因的初步筛选 | 第35-36页 |
| 3.4 降解组测序分析 | 第36-43页 |
| 3.4.1 降解组测序质量分析 | 第36-37页 |
| 3.4.2 非编码RNA注释 | 第37页 |
| 3.4.3 降解位点分析 | 第37-38页 |
| 3.4.4 靶基因的GO分类 | 第38-39页 |
| 3.4.5 靶基因的COG注释 | 第39页 |
| 3.4.6 靶基因KEGG注释及通路富集分析 | 第39-41页 |
| 3.4.7 控制粒重和含油量候选基因的初步筛选 | 第41-43页 |
| 3.5 实时荧光定量PCR验证测序结果 | 第43-46页 |
| 3.5.1 差异表达已知miRNAs的荧光定量PCR验证 | 第43页 |
| 3.5.2 差异表达miRNAs靶基因的荧光定量PCR验证 | 第43-46页 |
| 第四章 讨论 | 第46-50页 |
| 4.1 小RNA测序分析 | 第46-47页 |
| 4.2 降解组测序分析 | 第47-50页 |
| 第五章 全文结论及后续工作 | 第50-52页 |
| 5.1 全文结论 | 第50-51页 |
| 5.2 后续工作 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-60页 |
| 附录 | 第60-79页 |
| 致谢 | 第79-80页 |
| 作者简历 | 第80页 |
