Dedication | 第4-5页 |
Acknowledgement | 第5-7页 |
Table of Contents | 第7-9页 |
List of Figures | 第9-11页 |
List of Tables | 第11-12页 |
Abbreviations | 第12-13页 |
Summary | 第13-15页 |
摘要 | 第16-18页 |
1. General Introduction | 第18-22页 |
1.1 Background information | 第18-21页 |
1.2 Research objectives | 第21-22页 |
1.2.1 General objective | 第21页 |
1.2.2 Specific objectives | 第21-22页 |
2. Literature Review | 第22-38页 |
2.1 Geminivirus plant pathogens | 第22-23页 |
2.2 Geminivirus taxonomy and genome organization | 第23-30页 |
2.2.1 Genus Mastrevirus | 第23-24页 |
2.2.2 Genus Curtovirus | 第24-25页 |
2.2.3 Genus Topocuvirus | 第25页 |
2.2.4 Genus Begomovirus | 第25-30页 |
2.3 Geminivirus genome replication and transcription | 第30-31页 |
2.4 Geminivectors | 第31-35页 |
2.5 Role of weed plant species in the etiology of begomovirus diseases | 第35-36页 |
2.6 Begomovirus diseases of the tomato crop | 第36-38页 |
3. Experimental Procedures | 第38-47页 |
3.1 Extraction of total DNA | 第38-39页 |
3.2 PCR amplification of viral DNA fragments | 第39-41页 |
3.2.1 PCR Mix | 第39页 |
3.2.2 PCR Program for amplification of partial (~500 bp)viral DNA fragments | 第39-40页 |
3.2.3 PCR Program for amplification of complete (~2.7 kb) viral DNA | 第40页 |
3.2.4 PCR Program for amplification of putative satellite DNAβ (~1.3 kb) | 第40-41页 |
3.3 Cloning | 第41-42页 |
3.3.1 T-cloning | 第41-42页 |
3.3.2 Cloning in the expression binary vector pBinPLUS | 第42页 |
3.4 Transformation of plasmids into competent E. coli cells | 第42-43页 |
3.5 Restriction enzyme digests | 第43-44页 |
3.5.1 BamH1/EcoR1 double digestion of pMD 18-T-ZJ16full plasmid or pBinPLUS vector | 第43页 |
3.5.2 BamH1 digestion of pMD 18-T-ZJ 16full plasmid or pB inPLUS-ZJ 16-0.4mer | 第43-44页 |
3.6 Southern blot hybridization analysis | 第44-47页 |
4. Molecular characterization of Malvastrum leaf curl Guangdong virus isolated from Fujian, China | 第47-58页 |
Abstract | 第47页 |
4.1 Introduction | 第47-48页 |
4.2 Materials and methods | 第48-51页 |
4.2.1 Sample collection | 第48-49页 |
4.2.2 Viral DNA cloning and sequencing | 第49页 |
4.2.3 Sequence analysis | 第49-50页 |
4.2.4 Southern blot hybridization analysis for DNAβ | 第50-51页 |
4.3 Results | 第51-56页 |
4.4 Discussion | 第56-58页 |
5. Identification and characterization of tomato-infecting begomoviruses in Zhejiang Province, China | 第58-79页 |
Abstract | 第58页 |
5.1 Introduction | 第58-60页 |
5.2 Materials and methods | 第60-66页 |
5.3.1 Sample collection | 第60-61页 |
5.3.2 Virus DNA cloning and sequencing | 第61-62页 |
5.3.3 Sequence analysis | 第62页 |
5.3.4 Southern blot hybridization analysis for DNAβ | 第62-63页 |
5.3.5 Construction of ToLCTWV infectious clone and agro-inoculation of plants | 第63-66页 |
5.3 Results | 第66-74页 |
5.4 Discussion | 第74-79页 |
References | 第79-93页 |
Appendix 1: Virus genes deposited in the GenBank | 第93-95页 |