| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 英文缩写词表 | 第12-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-28页 |
| 1.1 结核病概述 | 第14-16页 |
| 1.1.1 结核病危害及流行趋势 | 第14-15页 |
| 1.1.2 结核分枝杆菌的感染 | 第15-16页 |
| 1.1.3 人畜共患结核病的防治 | 第16页 |
| 1.2 结核病实验室诊断方法 | 第16-19页 |
| 1.2.1 传统细菌学诊断方法 | 第17页 |
| 1.2.2 分子生物学诊断方法 | 第17-18页 |
| 1.2.3 免疫学诊断方法 | 第18-19页 |
| 1.3 耐药结核病实验室诊断方法 | 第19-22页 |
| 1.3.1 传统比例法药敏试验 | 第19-20页 |
| 1.3.2 BACTEC液体培养法 | 第20页 |
| 1.3.3 分子生物学快速诊断方法 | 第20-22页 |
| 1.4 结核分枝杆菌耐药机制 | 第22-26页 |
| 1.4.1 异烟肼耐药的分子机制 | 第23-25页 |
| 1.4.2 链霉素耐药的分子机制 | 第25-26页 |
| 1.5 本课题的研究意义及主要内容 | 第26-28页 |
| 第二章 基因型诊断技术检测结核菌及其耐药性的应用评估 | 第28-41页 |
| 2.1 引言 | 第28-29页 |
| 2.2 实验材料与设备 | 第29-31页 |
| 2.2.1 主要仪器设备 | 第29-30页 |
| 2.2.2 主要试剂 | 第30页 |
| 2.2.3 培养基和溶液配制 | 第30-31页 |
| 2.3 实验流程 | 第31-32页 |
| 2.4 实验方法 | 第32-34页 |
| 2.4.1 菌株的扩增 | 第32页 |
| 2.4.2 实验标本的准备 | 第32-33页 |
| 2.4.3 罗氏固体培养 | 第33页 |
| 2.4.4 基因芯片检测方法 | 第33页 |
| 2.4.5 XpertMTB/RIF检测方法 | 第33-34页 |
| 2.4.6 GenoType?MTBDRplus检测方法 | 第34页 |
| 2.5 实验结果 | 第34-37页 |
| 2.5.1 罗氏固体培养检测结果 | 第34-35页 |
| 2.5.2 基因芯片检测结果 | 第35页 |
| 2.5.3 XpertMTB/RIF检测结果 | 第35-36页 |
| 2.5.4 GenoType?MTBDRplus检测结果 | 第36-37页 |
| 2.6 讨论 | 第37-40页 |
| 2.7 本章小结 | 第40-41页 |
| 第三章 异烟肼/链霉素耐药结核菌相关突变位点的鉴定 | 第41-56页 |
| 3.1 引言 | 第41-42页 |
| 3.2 实验材料与设备 | 第42-44页 |
| 3.2.1 主要仪器设备 | 第42-43页 |
| 3.2.2 主要试剂 | 第43页 |
| 3.2.3 培养基和常用溶液配制 | 第43-44页 |
| 3.3 实验流程 | 第44页 |
| 3.4 实验方法 | 第44-47页 |
| 3.4.1 结核分枝杆菌的扩增 | 第44页 |
| 3.4.2 基因组DNA的提取 | 第44页 |
| 3.4.3 PCR扩增 | 第44-46页 |
| 3.4.4 琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物 | 第46-47页 |
| 3.4.5 扩增产物序列分析 | 第47页 |
| 3.5 实验结果 | 第47-52页 |
| 3.5.1 基因组DNA提取 | 第47页 |
| 3.5.2 异烟肼耐药结核菌相关基因的序列分析 | 第47-49页 |
| 3.5.3 链霉素耐药结核菌相关基因的序列分析 | 第49-52页 |
| 3.6 讨论 | 第52-54页 |
| 3.7 本章小结 | 第54-56页 |
| 第四章 建立体外诱导耐异烟肼/链霉素结核分枝杆菌模型及耐药位点筛查 | 第56-73页 |
| 4.1 引言 | 第56-57页 |
| 4.2 实验材料与设备 | 第57-60页 |
| 4.2.1 主要仪器设备 | 第57页 |
| 4.2.2 主要试剂 | 第57-58页 |
| 4.2.3 培养基和常用溶液配制 | 第58-60页 |
| 4.3 实验流程 | 第60页 |
| 4.4 实验方法 | 第60-63页 |
| 4.4.1 标准菌株H37Rv体外诱导耐药试验 | 第60-61页 |
| 4.4.2 传统比例法药敏试验 | 第61-62页 |
| 4.4.3 诱导耐药株及未诱导对照株基因组DNA提取 | 第62-63页 |
| 4.4.4 琼脂糖凝胶电泳分析基因组DNA的纯度和完整性 | 第63页 |
| 4.4.5 Nanodrop检测基因组DNA的纯度和浓度 | 第63页 |
| 4.5 实验结果 | 第63-69页 |
| 4.5.1 不同代次不同药物浓度培养基上菌株的生长情况 | 第63-65页 |
| 4.5.2 诱导耐药株的药敏试验结果 | 第65-66页 |
| 4.5.3 基因组DNA质量检测 | 第66-67页 |
| 4.5.4.所有的单核苷酸多态性（SNPs）位点分布 | 第67-68页 |
| 4.5.5 非同义SNPs位点分布 | 第68-69页 |
| 4.6 讨论 | 第69-71页 |
| 4.7 本章小结 | 第71-73页 |
| 结论与展望 | 第73-76页 |
| 参考文献 | 第76-88页 |
| 附录 | 第88-94页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第94-95页 |
| 致谢 | 第95-96页 |
| 答辩委员会对论文的评定意见 | 第96页 |
