| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 1 文献综述 | 第13-27页 |
| 1.1 植物中硼的生理功能 | 第13-21页 |
| 1.1.1 硼在植物细胞壁中的作用 | 第13-17页 |
| 1.1.2 硼在细胞膜中的作用 | 第17-18页 |
| 1.1.3 硼在植物代谢过程中的作用 | 第18-21页 |
| 1.2 硼在植物体内吸收、运输和再利用 | 第21-23页 |
| 1.2.1 植物对硼的吸收以及再利用方式 | 第21-22页 |
| 1.2.2 植物硼转运子 | 第22页 |
| 1.2.3 植物体内硼酸转运通道 | 第22-23页 |
| 1.3 油菜硼高效的分子机制 | 第23-25页 |
| 1.3.1 甘蓝型油菜硼高效基因的定位 | 第23页 |
| 1.3.2 甘蓝型油菜硼转运子的克隆和鉴定 | 第23-24页 |
| 1.3.3 低硼胁迫下油菜根系蛋白质谱 | 第24-25页 |
| 1.4 高通量测序在植物养分高效研究领域的应用 | 第25-27页 |
| 1.4.1 转录组测序 | 第25-26页 |
| 1.4.2 转录组测序促进了植物养分高效的研究 | 第26-27页 |
| 2. 研究内容 | 第27-29页 |
| 2.1 研究内容 | 第27页 |
| 2.2 技术路线 | 第27-28页 |
| 2.3 技术路线 | 第28-29页 |
| 3 材料与方法 | 第29-36页 |
| 3.1 试验材料 | 第29页 |
| 3.2 试验方法 | 第29-32页 |
| 3.2.1 营养液培养试验 | 第29-30页 |
| 3.2.2 RNA的提取以及质量检测 | 第30-31页 |
| 3.2.3 半定量RT-PCR以及定量PCR检测步骤 | 第31-32页 |
| 3.3 Illumina Hiseq2000 转录组测序 | 第32-33页 |
| 3.3.1 cDNA文库的构建 | 第32-33页 |
| 3.3.2 cDNA文库质量的检测 | 第33页 |
| 3.3.3 DNA簇生成 | 第33页 |
| 3.3.4 HiSeq2000 上机测序 | 第33页 |
| 3.4 转录组测序数据质量的评估 | 第33-35页 |
| 3.4.1 测序错误率分布检查 | 第33页 |
| 3.4.2 测序数据的过滤 | 第33-34页 |
| 3.4.3 差异表达基因的筛选条件 | 第34页 |
| 3.4.4 差异表达基因的表达模式聚类、GO富集性、KEGG富集性分析 | 第34-35页 |
| 3.4.5 Real-Time PCR基因表达量检测 | 第35页 |
| 3.5 基因网络及种子基因预测 | 第35-36页 |
| 3.5.1 种子基因（Seed gene）预测 | 第35-36页 |
| 3.5.2 Cytoscape软件 | 第36页 |
| 4 结果 | 第36-107页 |
| 4.1 甘蓝型油菜硼高、低效品种转录组测序数据质量评估 | 第36-40页 |
| 4.1.1 油菜硼高、低效品种苗期对缺硼反应的差异 | 第36-37页 |
| 4.1.2 转录组测序原始数据及reads比对 | 第37-38页 |
| 4.1.3 转录组测序数据GC含量分布 | 第38-39页 |
| 4.1.4 测序错误率 | 第39-40页 |
| 4.2 不同硼水平下甘蓝型油菜硼高、低效品种总差异表达基因及其分布 | 第40-56页 |
| 4.2.1 硼高效和低效品种A、C基因组基因分布 | 第40-41页 |
| 4.2.2 硼高、低效品种差异表达基因 | 第41-56页 |
| 4.3 甘蓝型油菜细胞壁和细胞膜形成途径和代谢网络显著差异表达的基因 | 第56-89页 |
| 4.3.1 油菜细胞壁形成途径和代谢网络显著差异表达的基因 | 第56-80页 |
| 4.3.2 细胞膜合成和代谢途径中关键基因的基因网络 | 第80-89页 |
| 4.4 低硼胁迫下甘蓝型油菜硼高和低效品种转录因子表达谱的差异 | 第89-99页 |
| 4.4.1 低硼胁迫下甘蓝型油菜硼高、低效品种显著差异表达的转录因子 | 第89-91页 |
| 4.4.2 低硼胁迫下甘蓝型油菜硼高和低效品种WRKYs家族基因表达谱 | 第91-97页 |
| 4.4.3 低硼胁迫下甘蓝型油菜硼高、低效品种WRKY6 和其它基因的互作网络 | 第97-99页 |
| 4.5 不同硼水平下甘蓝型油菜硼高、低效品种硼转运子表达谱差异 | 第99-105页 |
| 4.5.1 低硼胁迫下硼高、低效品种BnNIP5;1 表达谱的差异 | 第99-101页 |
| 4.5.2 低硼胁迫下硼高、低效品种BnNIP6;1s表达谱的差异 | 第101-102页 |
| 4.5.3 低硼胁迫下硼高、低效品种BnBOR1s表达谱的差异 | 第102页 |
| 4.5.4 其它转运子 | 第102-105页 |
| 4.6 候选基因的基因表达水平验证 | 第105-107页 |
| 5 讨论 | 第107-113页 |
| 5.1 低硼胁迫和正常硼处理,甘蓝型油菜硼高、低效品种根、老叶和新叶差异表达基因 | 第107-108页 |
| 5.2 硼与细胞壁和细胞膜 | 第108-109页 |
| 5.3 硼相关的转录因子和转运子 | 第109-111页 |
| 5.4 甘蓝型油菜响应低硼胁迫关键候选基因 | 第111-113页 |
| 6 结论与展望 | 第113-116页 |
| 6.1 结论 | 第113-114页 |
| 6.2 展望 | 第114-116页 |
| 6.2.1 油菜响应低硼胁迫的关键基因的功能分析 | 第114页 |
| 6.2.2 重要硼高效QTL的分离克隆 | 第114-115页 |
| 6.2.3 可变剪切分析 | 第115-116页 |
| 参考文献 | 第116-124页 |
| 致谢 | 第124-125页 |
| 作者简介 | 第125页 |
| 在读期间拟发表论文 | 第125页 |
| 会议摘要 | 第125页 |
| 获奖情况 | 第125页 |
