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砷污染环境微生物群落分析及耐砷菌Bacillus sp.JH-5-4特征研究

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
第一章 前言第12-21页
    1.1 砷污染概述第12-16页
        1.1.1 砷元素概述第12-13页
        1.1.2 砷污染的危害第13-14页
        1.1.3 微生物对砷污染的耐受性机制第14-16页
    1.2 抗生素污染概述第16-18页
        1.2.1 抗生素概述第16-17页
        1.2.2 抗生素污染的危害第17页
        1.2.3 微生物对抗生素污染的抗性机制第17-18页
    1.3 高通量测序在环境微生物方面的应用第18-19页
    1.4 课题背景与内容第19-21页
        1.4.1 研究背景与目的第19页
        1.4.2 研究内容与技术路线第19-21页
第二章 实验材料与实验方法第21-26页
    2.1 实验试剂第21页
    2.2 实验仪器与设备第21-22页
    2.3 微生物实验手段第22-26页
        2.3.1 环境样品DNA提取第22-24页
        2.3.2 PCR扩增第24-25页
        2.3.3 高通量测序分析第25-26页
第三章 调查区域概况第26-31页
    3.1 区域概况第26页
    3.2 样品采集第26-27页
    3.3 样品化学指标第27-29页
    3.4 本章小结第29-31页
第四章 研究区域内微生物群落第31-60页
    4.1 OTU及原始数据分析第32-34页
    4.2 样品内多样性分析第34-35页
    4.3 微生物群落结构分析第35-41页
    4.4 样品聚类及属(Genus)水平相对丰度分析第41-44页
    4.5 微生物种(Species)OTU丰度分析第44-48页
    4.6 群落结构与环境因子相关性分析第48-54页
    4.7 基因分析第54-58页
        4.7.1 arsB功能基因分析第55-56页
        4.7.2 ACR3功能基因分析第56-58页
    4.8 本章小结第58-60页
第五章 耐砷菌种筛选培养及功能表达第60-79页
    5.1 耐砷菌种的分离第60-62页
    5.2 筛选耐受性菌种的鉴别第62页
    5.3 耐受性菌种的生长第62-77页
        5.3.1 pH变化及不同培养基对耐受性菌种生长的影响第62-64页
        5.3.2 菌种生长对于培养环境pH的影响第64-66页
        5.3.3 耐受性菌种的实验室内培养第66-68页
        5.3.4 砷对耐受性菌种生长情况的影响第68-69页
        5.3.5 抗生素和砷共同作用于耐受性菌种的影响第69-74页
        5.3.6 不同环境下耐受性菌种的耐受性基因第74-77页
    5.4 本章小结第77-79页
第六章 结论第79-81页
致谢第81-82页
参考文献第82-85页
附录第85-87页

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