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胡杨/灰杨尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因家族的克隆和功能研究

中文摘要第3-5页
Abstract第5-7页
第一章 前言第11-22页
    1.1 糖代谢第11-12页
    1.2 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UGPase)和相关的研究进展第12-20页
        1.2.1 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶催化反应第12-13页
        1.2.2 UGPase是植物生长中重要的限速酶第13-14页
        1.2.3 UGPase的同工酶和拷贝数第14-15页
        1.2.4 UGPase和相关蛋白的进化第15-16页
        1.2.5 UGPase动力学特性第16-17页
        1.2.6 UGPase的体内调控第17页
        1.2.7 UGPase组织和亚细胞定位第17-18页
        1.2.8 UGPase三维结构第18-20页
    1.3 本实验的研究意义第20-22页
第二章 材料和方法第22-40页
    2.1 材料第22-23页
        2.1.1 植物材料第22页
        2.1.2 质粒和菌株第22页
        2.1.3 酶与试剂盒第22页
        2.1.4 主要的化学试剂第22-23页
        2.1.5 主要的抗生素第23页
        2.1.6 主要的分析软件第23页
        2.1.7 主要的仪器第23页
    2.2. 胡杨/灰杨愈伤组织和新鲜叶片组织总RNA的提取第23-26页
        2.2.1. CTAB法RNA提取法所需溶液的配制第23-24页
        2.2.2 RNA提取步骤第24-25页
        2.2.3 RNA提取过程中需要注意的事项第25页
        2.2.4 用琼脂糖电泳检测RNA的质量第25页
        2.2.5 测定RNA的浓度第25-26页
    2.3 用RT-PCR的方法获得胡杨灰杨UGP基因家族的cDNA全长第26-31页
        2.3.1 用反转录酶反转录RNA得到cDNA第26页
        2.3.2 扩增基因全长的PCR反应第26-29页
        2.3.3 对PCR产物进行切胶回收第29页
        2.3.4 目的基因的cDNA与克隆载体pMD19-T的连接第29-30页
        2.3.5 大肠杆菌DH5α的带有目的基因的pMD19-T载体质粒转化:第30页
        2.3.6 阳性克隆的鉴定和送测第30-31页
    2.4 UGP3Y_1和UGP3W单倍型原核表达体系的构建第31-35页
        2.4.1 质粒提取第31-32页
        2.4.2 目的基因和pET28a表达载体的双酶切第32页
        2.4.3 目的基因与pET28a表达载体的连接第32页
        2.4.4 重组质粒的转化、阳性克隆的鉴定和送测第32-33页
        2.4.5 原核表达系统中目的蛋白的条件优化第33页
        2.4.6 诱导的蛋白样品的SDS-PAGE电泳第33-34页
        2.4.7 大量靶基因的诱导表达第34页
        2.4.8 制备细胞抽提液第34页
        2.4.9 用Ni-NTA纯化目的蛋白第34-35页
    2.5 用Western blotting检测胡杨根茎叶中的UGPase蛋白第35-37页
        2.5.1 用丙酮沉淀法提取胡杨根茎叶总蛋白第35页
        2.5.2 Western blotting检测胡杨根茎叶中的UGPase蛋白第35-37页
    2.6 胡杨扦插幼苗的盐处理第37页
    2.7 荧光实时定量RT-PCR(SYBR Green法)第37-40页
        2.7.1 反转录第37-38页
        2.7.2 用Rotor Gene 3000 PCR扩增仪进行荧光实时定量的步骤第38-40页
第三章 实验结果第40-57页
    3.1 实验材料总RNA的提取第40页
    3.2 胡杨灰杨UGP基因家族的编码区全长的扩增和分析第40-45页
        3.2.1 阳性克隆的菌检胶图第40-41页
        3.2.2 胡杨/灰杨UGP基因家族编码区序列比对第41-45页
    3.3 UGP3原核表达体系的构建和蛋白的诱导表达第45-47页
        3.3.1:表达载体和目的基因质粒的双酶切第45-46页
        3.3.2 UGP3Y_1和UGP3Y_2单倍型的异源表达第46-47页
    3.4 Western blotting检测胡杨根茎叶中的UGPase蛋白第47-48页
    3.5 UGP3三个单倍型的保守结构和三维结构的模拟分析第48-52页
        3.5.1 UGP3的保守结构第48页
        3.5.2 UGP3Y_1/UGP3Y_2/UGP3W蛋白三维结构的模拟第48-52页
    3.6 胡杨UGPase基因家族的时空表达第52页
    3.7 盐处理的胡杨幼苗中UGP基因家族荧光实时定量RT-PCR结果第52-57页
第四章 讨论第57-61页
    4.1 实验材料第57页
    4.2 胡杨灰杨UGPase基因家族的扩增与进化分析第57-58页
    4.3 UGPase基因家族的功能分析第58-59页
    4.4 UGPase基因家族Real-time PCR结果分析第59-61页
第五章 结论第61-63页
参考文献第63-70页
在读期间参与学术成果第70-71页
致谢第71页

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