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组蛋白修饰对里氏木霉纤维素酶表达的初步研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第1章 前言第11-19页
    1.1 真菌表观遗传调控第11-15页
        1.1.1 DNA甲基化第11-12页
        1.1.2 组蛋白修饰第12-15页
    1.2 基因敲除以及在真菌研究中的应用第15-16页
    1.3 RNA干扰在真菌研究中的应用第16-17页
    1.4 本工作的研究目的和主要研究内容第17-19页
        1.4.1 研究目的第17-18页
        1.4.2 研究内容第18-19页
第2章 敲除组蛋白H3赖氨酸甲基转移酶基因hkmt对里氏木霉表达纤维素酶的影响第19-40页
    2.1 材料第19-21页
        2.1.1 菌株与质粒第19页
        2.1.2 试剂与培养基第19-21页
        2.1.3 仪器第21页
    2.2 实验方法第21-30页
        2.2.1 T. reesei QM9414基因组DNA的提取第21-22页
        2.2.2 敲除表达盒的构建第22-23页
        2.2.3 Overlap法进行片段连接第23-24页
        2.2.4 T. reesei QM9414原生质体的制备及转化第24-25页
        2.2.5 hkmt基因敲除转化子的筛选与验证第25-26页
        2.2.6 Southern blotting验证hkmt基因敲除转化子第26-28页
        2.2.7 荧光定量PCR第28-30页
        2.2.8 酶活测定(FPA和CMCA)第30页
    2.3 实验结果第30-38页
        2.3.1 组蛋白甲基转移酶基因敲除盒的构建第30-32页
        2.3.2 里氏木霉组蛋白甲基转移酶缺失转化子鉴定第32-34页
        2.3.3 Southern blotting验证第34页
        2.3.4 里氏木霉出发株与组蛋白甲基转移酶缺失突变株的表型分析第34-35页
        2.3.5 组蛋白甲基转移酶缺失突变菌株的FPA和CMCA的测定第35-36页
        2.3.6 qPCR分析组蛋白甲基转移酶缺失突变菌株的转录水平第36-38页
    2.4 分析与讨论第38-40页
        2.4.1 基因敲除第38页
        2.4.2 抗性标记基因的选择第38页
        2.4.3 融合PCR第38-39页
        2.4.4 里氏木霉 Δhkmt突变株的筛选第39页
        2.4.5 组蛋白甲基转移酶hkmt对里氏木霉表型的影响第39页
        2.4.6 里氏木霉 Δhkmt突变株的滤纸酶和CMC酶活以及转录水平分析第39-40页
        2.4.7 创新点第40页
第3章 敲除组蛋白去乙酰化酶基因hdac对里氏木霉表达纤维素酶的影响第40-52页
    3.1 材料第40-41页
        3.1.1 菌株与质粒第40页
        3.1.2 试剂与培养基第40页
        3.1.3 仪器第40-41页
    3.2 实验方法第41-43页
        3.2.1 T. reesei QM9414基因组DNA的提取第41页
        3.2.2 敲除表达盒的构建第41-42页
        3.2.3 Overlap法进行片段连接第42页
        3.2.4 T. reesei QM9414原生质体的制备及转化第42页
        3.2.5 hdac基因敲除转化子的筛选与验证第42-43页
        3.2.6 Southern blotting验证hkmt基因敲除转化子第43页
        3.2.7 荧光定量PCR(RT-q PCR)第43页
        3.2.8 酶活测定(滤纸酶活和CMC酶活)第43页
    3.3 实验结果第43-50页
        3.3.1 组蛋白去乙酰化酶基因敲除盒的构建第43-44页
        3.3.2 里氏木霉组蛋白去乙酰化酶缺失转化子鉴定第44-46页
        3.3.3 Southern blotting验证第46页
        3.3.4 里氏木霉出发株与组蛋白去乙酰化酶缺失突变株的表型分析第46-47页
        3.3.5 组蛋白去乙酰化酶缺失突变菌株的FPA和CMCA的测定第47-48页
        3.3.6 qPCR分析组蛋白去乙酰化酶缺失突变菌株的转录水平第48-50页
    3.4 分析与讨论第50-52页
        3.4.1 组蛋白去乙酰化酶hdac对里氏木霉表型的影响第50页
        3.4.2 里氏木霉 Δhdac突变株的滤纸酶和CMC酶活以及转录水平第50-51页
        3.4.3 创新点第51-52页
第4章 siRNA干扰组蛋白乙酰化酶基因gcn5对里氏木霉表达纤维素酶的影响第52-69页
    4.1 材料第52-53页
        4.1.1 菌株与质粒第52页
        4.1.2 主要试剂第52页
        4.1.3 培养基及相关溶液的配制第52-53页
        4.1.4 主要仪器第53页
    4.2 实验方法第53-57页
        4.2.1 T. reesei gcn5干扰重组质粒的构建以及鉴定第53-56页
        4.2.2 T. reesei QM9414基因组DNA的提取第56页
        4.2.3 T. reesei QM9414原生质体的制备及转化第56页
        4.2.4 gcn5干扰载体转化子的鉴定第56-57页
        4.2.5 gcn5干扰重组菌对孢子与菌丝的影响第57页
        4.2.6 荧光定量PCR第57页
        4.2.7 酶活测定(滤纸酶活和CMC酶活)第57页
    4.3 结果第57-67页
        4.3.1 gcn5-siRNA干扰载体的构建和鉴定第57-58页
        4.3.2 干扰重组菌的鉴定第58-60页
        4.3.3 gcn5干扰重组菌对孢子与菌丝的影响第60-62页
        4.3.4 gcn5干扰重组菌的FPA和CMCA测定第62-63页
        4.3.5 干扰重组菌转录水平的基因相对表达量分析第63-66页
        4.3.6 干扰重组菌中组蛋白去乙酰化转移酶基因hdac以及组蛋白H3甲基化转移酶基因hkmt相对表达量第66-67页
    4.4 讨论第67-69页
结论第69-71页
参考文献第71-78页
附录A 英文缩略词第78-79页
附录B 荧光定量PCR相关曲线第79-81页
附录C 测序结果第81-85页
致谢第85-86页
攻读硕士学位期间研究成果第86页

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