| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-17页 |
| 1.1 ‘无子瓯柑’简介 | 第11-12页 |
| 1.2 果树芽变研究 | 第12-13页 |
| 1.2.1 芽变的分子机理 | 第12页 |
| 1.2.2 分子标记在芽变品种鉴定中的应用 | 第12-13页 |
| 1.3 植物减数分裂研究进展 | 第13-16页 |
| 1.3.0 减数分裂在果树中的研究进展 | 第13-14页 |
| 1.3.1 减数分裂在草本植物中的研究进展 | 第14-16页 |
| 1.3.1.1 转录组研究 | 第14-15页 |
| 1.3.1.2 减数分裂基因的功能研究 | 第15-16页 |
| 1.4 研究目的和意义 | 第16-17页 |
| 第二章 小孢子母细胞发育过程的观察 | 第17-23页 |
| 2.1 材料与方法 | 第17-18页 |
| 2.1.1 材料 | 第17页 |
| 2.1.2 酸解压片 | 第17页 |
| 2.1.3 石蜡切片 | 第17-18页 |
| 2.2 结果与分析 | 第18-23页 |
| 2.2.1 瓯柑小孢子母细胞发育过程的观察 | 第18-20页 |
| 2.2.1.1 花蕾直径与减数分裂时期的关系 | 第18-19页 |
| 2.2.1.2 瓯柑花蕾直径与花粉发育时期的关系 | 第19-20页 |
| 2.2.2 ‘无子瓯柑’小孢子母细胞减数分裂的异常现象 | 第20-22页 |
| 2.2.3 四分体解体时的小孢子形态观察 | 第22-23页 |
| 第三章 小孢子母细胞时期花药的转录组测序 | 第23-38页 |
| 3.1 材料与方法 | 第23页 |
| 3.1.1 材料采集 | 第23页 |
| 3.2 实验流程 | 第23-24页 |
| 3.2.1 RNA提取 | 第23页 |
| 3.2.2 RNA样品检测 | 第23页 |
| 3.2.3 RNA文库构建 | 第23页 |
| 3.2.4 文库质控 | 第23-24页 |
| 3.2.5 上机测序 | 第24页 |
| 3.3 生物信息学分析 | 第24-28页 |
| 3.3.1 转录组测序数据饱和度检验 | 第24-25页 |
| 3.3.2 Unigene功能注释 | 第25-26页 |
| 3.3.3 基因结构分析 | 第26-27页 |
| 3.3.3.1 编码区序列预测 | 第26页 |
| 3.3.3.2 简单重复序列分析 | 第26-27页 |
| 3.3.3.3 SNP分析 | 第27页 |
| 3.3.4 差异表达分析 | 第27-28页 |
| 3.3.4.1 Unigene表达量计算 | 第27-28页 |
| 3.3.4.2 差异表达基因筛选 | 第28页 |
| 3.4 实验结果 | 第28-37页 |
| 3.4.1 测序数据产出统计 | 第28页 |
| 3.4.2 组装结果统计 | 第28-30页 |
| 3.4.3 测序数据与组装结果的比对统计 | 第30页 |
| 3.4.4 Unigene注释统计 | 第30-31页 |
| 3.4.5 简单重复序列分析 | 第31页 |
| 3.4.6 SNP位点发掘 | 第31-32页 |
| 3.4.7 差异表达基因 | 第32-37页 |
| 3.4.7.1 差异表达基因筛选 | 第32-33页 |
| 3.4.7.2 差异表达基因聚类分析 | 第33-34页 |
| 3.4.7.3 差异表达基因GO功能富集 | 第34-35页 |
| 3.4.7.4 差异表达基因COG分类 | 第35-36页 |
| 3.4.7.5 差异表达基因KEGG注释 | 第36-37页 |
| 3.5 讨论 | 第37-38页 |
| 第四章 差异表达基因的RT-QPCR验证 | 第38-46页 |
| 4.1 材料与方法 | 第38页 |
| 4.1.1 植物材料 | 第38页 |
| 4.1.2 主要试剂 | 第38页 |
| 4.1.3 主要仪器 | 第38页 |
| 4.2 试验方法 | 第38-41页 |
| 4.2.1 差异表达基因的选择 | 第38页 |
| 4.2.2 特异性引物设计 | 第38-39页 |
| 4.2.3 内参引物 | 第39页 |
| 4.2.4 DNA消化与cDNA的合成 | 第39-40页 |
| 4.2.5 模板与引物验证 | 第40页 |
| 4.2.6 实时荧光定量PCR | 第40-41页 |
| 4.3 结果与分析 | 第41-44页 |
| 4.3.1 模板与引物检测 | 第41页 |
| 4.3.2 差异基因的表达分析 | 第41-44页 |
| 4.3.2.1 转录组结果中23个差异基因的表达情况 | 第41-44页 |
| 4.3.2.2 RT-QPCR中23个差异基因的表达情况 | 第44页 |
| 4.4 讨论 | 第44-46页 |
| 第五章 小孢子发育过程中减数分裂基因的表达规律 | 第46-60页 |
| 5.1 材料与方法 | 第46页 |
| 5.1.1 植物材料 | 第46页 |
| 5.1.2 主要试剂 | 第46页 |
| 5.1.3 主要仪器 | 第46页 |
| 5.2 试验方法 | 第46-50页 |
| 5.2.1 提取总RNA | 第46页 |
| 5.2.2 cDNA的合成 | 第46页 |
| 5.2.3 减数分裂基因的选择 | 第46-49页 |
| 5.2.4 特异性引物设计 | 第49-50页 |
| 5.2.5 模板与引物验证 | 第50页 |
| 5.2.6 实时荧光定量PCR | 第50页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第50-60页 |
| 5.3.1 模板与引物检测 | 第50页 |
| 5.3.2 减数分裂基因的表达分析 | 第50-60页 |
| 5.3.2.1 调控DNA双链解开的基因 | 第53-54页 |
| 5.3.2.2 解除SPO11与 5’末端共价结合的基因 | 第54-55页 |
| 5.3.2.3 修复DSB的基因 | 第55页 |
| 5.3.2.4 同源染色体交换的功能基因 | 第55-56页 |
| 5.3.2.5 维持姐妹染色单体着丝粒处黏连功能的基因 | 第56-57页 |
| 5.3.2.6 四分体时期作用基因 | 第57-58页 |
| 5.3.2.7 细胞周期调节基因 | 第58页 |
| 5.3.2.8 染色体分离相关基因 | 第58-60页 |
| 第六章 总结 | 第60-63页 |
| 6.1 瓯柑小孢子母细胞发育过程的观察 | 第60页 |
| 6.1.1 花蕾直径与减数分裂时期的关系 | 第60页 |
| 6.1.2 ‘无子瓯柑’小孢子母细胞减数分裂的异常现象 | 第60页 |
| 6.2 转录组结果的富集分析 | 第60-61页 |
| 6.3 差异基因的表达量验证 | 第61页 |
| 6.4 减数分裂基因在小孢子发育过程中的表达规律 | 第61页 |
| 6.5 败育花粉形成原因 | 第61-63页 |
| 第七章 展望 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-74页 |
| 个人简介 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75页 |
