| 摘要 | 第8-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 符号及缩略语说明 | 第15-16页 |
| 前言 | 第16-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-35页 |
| 第一节 道地性药材概述 | 第17-21页 |
| 1 道地药材的发展历史 | 第17-18页 |
| 2 道地药材形成原因 | 第18-19页 |
| 2.1 药材的遗传物质 | 第18页 |
| 2.2 道地药材的自然环境 | 第18-19页 |
| 2.3 道地性产区特殊的栽培技术和采收加工技术 | 第19页 |
| 3 药材山药的道地性文献考证 | 第19-21页 |
| 第二节 药用植物的鉴别方法 | 第21-29页 |
| 1 形态学鉴定 | 第21页 |
| 2 理化鉴定 | 第21-22页 |
| 3 三维定量鉴定 | 第22页 |
| 4 DNA分子标记鉴定 | 第22-26页 |
| 4.1 RAPD分子标记 | 第23页 |
| 4.2 AFLP分子标记 | 第23-24页 |
| 4.3 ISSR分子标记 | 第24页 |
| 4.4 SRAP分子标记 | 第24-25页 |
| 4.5 ISAP分子标记 | 第25页 |
| 4.6 SCAR分子标记 | 第25-26页 |
| 5 山药基源植物的鉴定研究 | 第26-29页 |
| 第三节 与珠芽发生相关的分子基础研究 | 第29-31页 |
| 1 植物珠芽发生的研究概况 | 第29页 |
| 2 转录组测序在植物器官发生过程中的应用 | 第29-31页 |
| 第四节 本研究的意义、内容和技术路线 | 第31-35页 |
| 1 研究的目的与意义 | 第31页 |
| 2 研究的内容 | 第31-33页 |
| 3 技术路线 | 第33-35页 |
| 第二章 基于SRAP-SCAR标记的薯蓣物种特异性分子鉴定 | 第35-53页 |
| 1 材料与方法 | 第36-41页 |
| 1.1 实验材料 | 第36-40页 |
| 1.2 实验方法 | 第40-41页 |
| 1.2.1 总DNA的提取 | 第40页 |
| 1.2.2 基因组DNA检测 | 第40页 |
| 1.2.3 SRAP反应体系的建立 | 第40-41页 |
| 1.2.4 SRAP引物的筛选 | 第41页 |
| 1.2.5 遗传关系分析 | 第41页 |
| 1.2.6 SRAP-SCAR特异条带的选择 | 第41页 |
| 1.2.7 SRAP-SCAR分子鉴别体系的建立 | 第41页 |
| 2 结果与分析 | 第41-50页 |
| 2.1 薯蓣及其近缘种之间的遗传多样性分析 | 第41-46页 |
| 2.2 基于SRAP-SCAR标记的薯蓣物种特异性鉴定 | 第46-50页 |
| 3 讨论 | 第50-53页 |
| 3.1 遗传多样性分析 | 第50-51页 |
| 3.2 物种之间遗传关系分析 | 第51-52页 |
| 3.3 SCAR标记的鉴定作用 | 第52-53页 |
| 第三章 基于ISAP-SCAR标记的薯蓣品种特异性分子鉴定 | 第53-71页 |
| 1 材料与方法 | 第54-57页 |
| 1.1 实验材料 | 第54-56页 |
| 1.2 实验方法 | 第56-57页 |
| 1.2.1 总DNA的提取 | 第56页 |
| 1.2.2 ISAP反应体系的建立 | 第56页 |
| 1.2.3 ISAP引物的筛选 | 第56页 |
| 1.2.4 遗传关系的分析 | 第56-57页 |
| 1.2.5 ISAP-SCAR特异性条带选择 | 第57页 |
| 1.2.6 ISAP-SCAR分子鉴别体系的建立 | 第57页 |
| 2 结果与分析 | 第57-68页 |
| 2.1 薯蓣不同品种基于ISAP分子标记的遗传关系分析 | 第57-64页 |
| 2.2 基于ISAP-SCAR标记的铁棍山药品种特异性鉴定 | 第64-68页 |
| 3 讨论 | 第68-71页 |
| 3.1 薯蓣品种之间的遗传关系 | 第68-69页 |
| 3.2 关于铁棍山药特异性的SCAR标记 | 第69-71页 |
| 第四章 基于ISSR-SCAR标记的铁棍山药区域特异性分子鉴定 | 第71-89页 |
| 1 材料与方法 | 第72-74页 |
| 1.1 实验材料 | 第72-73页 |
| 1.2 实验方法 | 第73-74页 |
| 1.2.1 总DNA的提取 | 第73页 |
| 1.2.2 基因组DNA检测 | 第73页 |
| 1.2.3 ISSR反应体系的建立 | 第73页 |
| 1.2.4 ISSR引物的筛选 | 第73页 |
| 1.2.5 遗传关系分析 | 第73-74页 |
| 1.2.6 ISSR-SCAR特异条带的选择 | 第74页 |
| 1.2.7 ISSR-SCAR分子鉴别体系的建立 | 第74页 |
| 2 结果与分析 | 第74-85页 |
| 2.1 不同产区铁棍山药基于ISSR分子标记的遗传关系分析 | 第74-79页 |
| 2.2 基于ISSR-SCAR标记的铁棍山药区域特异性鉴定 | 第79-82页 |
| 2.2.1 铁棍山药ISSR特异性条带的筛选 | 第79页 |
| 2.2.2 河南铁棍山药ISSR特异性条带测序、SCAR引物设计 | 第79-80页 |
| 2.2.3 铁棍山药区域特异性鉴定ISSR-SCAR分子标记的个体验证 | 第80-82页 |
| 2.3 基于ISSR、ISAP及SRAP数据对薯蓣遗传关系的综合分析 | 第82-85页 |
| 2.3.1 综合分析的薯蓣遗传关系聚类图 | 第82-84页 |
| 2.3.2 综合分析的薯蓣种质资源的遗传关系 | 第84-85页 |
| 3 讨论 | 第85-89页 |
| 3.1 各栽培区铁棍山药的遗传关系 | 第85-86页 |
| 3.2 铁棍山药区域特异性鉴定的ISSR-SCAR分子标记的可用性 | 第86页 |
| 3.3 综合所有样品的遗传关系 | 第86-89页 |
| 第五章 转录组测序的薯蓣珠芽发生基因研究 | 第89-109页 |
| 1 材料与方法 | 第90-95页 |
| 1.1 实验材料 | 第90-91页 |
| 1.2 总RNA提取及检测 | 第91-92页 |
| 1.3 cDNA的合成与测序 | 第92-94页 |
| 1.3.1 样品RNA中的DNA的去除 | 第92页 |
| 1.3.2 cDNA文库的构建 | 第92页 |
| 1.3.3 序列的拼接 | 第92-93页 |
| 1.3.4 基因的功能注释 | 第93-94页 |
| 1.3.5 样本之间Unigene的表达差异分析 | 第94页 |
| 1.4 EST-SSR检测与引物设计 | 第94-95页 |
| 2 结果与分析 | 第95-106页 |
| 2.1 测序结果与组装分析 | 第95-96页 |
| 2.2 Unigene功能注释及COG分类 | 第96-98页 |
| 2.3 Unigene表达差异分析 | 第98-100页 |
| 2.4 参与薯蓣珠芽形成的候选基因分析 | 第100-104页 |
| 2.5 EST-SSR的分布特征与引物开发 | 第104-106页 |
| 3 讨论 | 第106-109页 |
| 参考文献 | 第109-121页 |
| 全文结论 | 第121-123页 |
| 论文创新点与不足之处 | 第123-125页 |
| 1 创新点 | 第123页 |
| 2 不足处 | 第123-125页 |
| 附图 | 第125-129页 |
| 攻读博士期间发表论文情况 | 第129-131页 |
| 致谢 | 第131页 |
