| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 符号或缩略词说明 | 第10-11页 |
| 前言 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-23页 |
| 1.1 黑枸杞的研究现状 | 第12-14页 |
| 1.1.1 黑枸杞的形态特征 | 第12页 |
| 1.1.2 黑枸杞的地理分布与生长环境 | 第12页 |
| 1.1.3 黑枸杞化学成分及其生物活性 | 第12-14页 |
| 1.1.4 组织培养研究 | 第14页 |
| 1.2 花青素简述 | 第14-21页 |
| 1.2.1 化学结构和分类 | 第14-16页 |
| 1.2.2 花青素的药用价值 | 第16-17页 |
| 1.2.2.1 抗癌作用 | 第16页 |
| 1.2.2.2 抗炎、抗菌作用 | 第16页 |
| 1.2.2.3 抗衰老作用 | 第16-17页 |
| 1.2.3 花青素的生物合成途径 | 第17页 |
| 1.2.4 花青素合成代谢途径的相关酶和结构基因 | 第17-20页 |
| 1.2.5 花青素生物合成代谢相关的调控基因 | 第20-21页 |
| 1.2.5.1 MYB类转录因子 | 第20页 |
| 1.2.5.2 BHLH类转录因子 | 第20页 |
| 1.2.5.3 WD40重复蛋白 | 第20-21页 |
| 1.3 转录组 | 第21-23页 |
| 1.3.1 高通量测序技术的发展 | 第21-22页 |
| 1.3.2 转录组测序在高等植物中的应用 | 第22-23页 |
| 第二章 研究目的、意义及内容 | 第23-25页 |
| 2.1 研究的目的及意义 | 第23页 |
| 2.2 主要研究内容 | 第23-25页 |
| 2.2.1 高通量测序 | 第23页 |
| 2.2.2 基因的克隆及生物信息学的分析 | 第23-24页 |
| 2.2.3 黑枸杞组织培养再生体系的研究 | 第24-25页 |
| 第三章 材料与方法 | 第25-34页 |
| 3.1 基于Solexa测序技术对红枸杞与黑枸杞转录组分析 | 第25-27页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第25页 |
| 3.1.2 转录组测序 | 第25-27页 |
| 3.1.2.1 枸杞总RNA提取 | 第25-26页 |
| 3.1.2.2 Illumina测序 | 第26页 |
| 3.1.2.3 数据过滤和组装 | 第26页 |
| 3.1.2.4 表达差异基因的分析 | 第26页 |
| 3.1.2.5 基因注释和分类 | 第26-27页 |
| 3.2 黑枸杞MYB基因的克隆与序列测序 | 第27-31页 |
| 3.2.1 实验试剂及仪器 | 第27页 |
| 3.2.2 引物设计 | 第27-28页 |
| 3.2.3 RNA的提取 | 第28页 |
| 3.2.4 RNA反转录 | 第28页 |
| 3.2.5 PCR扩增 | 第28-29页 |
| 3.2.6 加A | 第29页 |
| 3.2.7 cDNA回收 | 第29-30页 |
| 3.2.8 pGEM-T Easy载体链接 | 第30页 |
| 3.2.9 链接产物转E.coli细胞 | 第30页 |
| 3.2.10 重组克隆筛选 | 第30页 |
| 3.2.11 穿刺 | 第30-31页 |
| 3.2.12 送样测序 | 第31页 |
| 3.3 黑枸杞组织培养再生体系的建立 | 第31-34页 |
| 3.3.1 实验材料 | 第31页 |
| 3.3.2 实验方法 | 第31-34页 |
| 3.3.2.1 MS培养基的配制 | 第31页 |
| 3.3.2.2 黑枸杞外植体的灭菌和处理 | 第31-32页 |
| 3.3.2.3 黑枸杞愈伤组织的诱导 | 第32页 |
| 3.3.2.4 黑枸杞愈伤组织的继代培养 | 第32页 |
| 3.3.2.5 黑枸杞愈伤组织的分化培养 | 第32-33页 |
| 3.3.2.6 黑枸杞生根培养 | 第33页 |
| 3.3.2.7 黑枸杞再生植株苗的炼苗与移栽 | 第33-34页 |
| 第四章 实验结果 | 第34-56页 |
| 4.1 红枸杞和黑枸杞转录组分析结果 | 第34-43页 |
| 4.1.1 RNA提取检测结果 | 第34页 |
| 4.1.2 测序结果 | 第34-43页 |
| 4.1.2.1 Illumina测序和序列组装 | 第34-36页 |
| 4.1.2.2 CDS预测 | 第36-37页 |
| 4.1.2.3 差异表达的基因分析 | 第37-38页 |
| 4.1.2.4 差异表达基因的GO功能 | 第38-39页 |
| 4.1.2.5 差异表达基因的KEGG代谢通路 | 第39-40页 |
| 4.1.2.6 与花青素合成代谢相关通路基因的表达谱分析 | 第40-43页 |
| 4.2 黑枸杞MYB基因克隆与表达分析 | 第43-50页 |
| 4.2.1 反转录加A后测序结果 | 第43页 |
| 4.2.2 DNA回收结果 | 第43-44页 |
| 4.2.3 T载体链接产物做DH5α（E.coli）细胞转化 | 第44-45页 |
| 4.2.4 菌落PCR阳性筛选 | 第45页 |
| 4.2.5 基因测序及生物信息学分析 | 第45-50页 |
| 4.2.6 红、黑枸杞中MYB基因的检测 | 第50页 |
| 4.3 黑枸杞再生组织培养体系的建立与分析 | 第50-56页 |
| 4.3.1 黑枸杞愈伤组织诱导与继代培养 | 第50-52页 |
| 4.3.2 黑枸杞愈伤组织的分化培养 | 第52-54页 |
| 4.3.3 黑枸杞生根培养 | 第54页 |
| 4.3.4 黑枸杞炼苗与移栽 | 第54-56页 |
| 第五章 讨论 | 第56-58页 |
| 第六章 结论 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-65页 |
| 致谢 | 第65页 |
