中文摘要 | 第1-10页 |
ABSTRACT | 第10-12页 |
第1章 绪论 | 第12-20页 |
·基因芯片 | 第12-16页 |
·基因芯片原理 | 第12-14页 |
·基因芯片的应用 | 第14-15页 |
·基因芯片的发展现状 | 第15-16页 |
·miRNA和lncRNA及研究现状 | 第16-17页 |
·let-7e | 第17页 |
·聚类分析 | 第17-18页 |
·靶基因预测 | 第18-19页 |
·本章小结 | 第19-20页 |
第2章 基因芯片实验 | 第20-30页 |
·内皮细胞培养、转染及总RNA提取 | 第20-24页 |
·实验材料及仪器 | 第20页 |
·人脐静脉内皮细胞的培养 | 第20-22页 |
·内皮细胞转染 | 第22-23页 |
·总RNA提取 | 第23-24页 |
·lncRNA芯片 | 第24-27页 |
·lncRNA基因组芯片 | 第24页 |
·lncRNA基因组芯片的数据来源 | 第24-25页 |
·芯片原理 | 第25-26页 |
·芯片步骤 | 第26-27页 |
·基因芯片实验结果 | 第27-28页 |
·本章小结 | 第28-30页 |
第3章 基因芯片数据分析方法 | 第30-42页 |
·基因芯片数据分析流程 | 第30-31页 |
·芯片数据标准化 | 第31-32页 |
·背景值修正 | 第31-32页 |
·分位数标准化 | 第32页 |
·寻找显著差异表达基因 | 第32-35页 |
·倍数法 | 第33页 |
·t检验控制假阳性率 | 第33-35页 |
·聚类分析-共表达基因 | 第35-39页 |
·聚类分析 | 第35-38页 |
·共表达分析 | 第38-39页 |
·let-7e靶基因预测 | 第39-40页 |
·lncRNA-let-7e-mRNA相互作用网络构建 | 第40页 |
·本章小结 | 第40-42页 |
第4章 基因芯片数据分析结果 | 第42-74页 |
·差异表达基因结果 | 第42-48页 |
·聚类分析 | 第48-56页 |
·lncRNA比对 | 第48-50页 |
·inhibitor组结果 | 第50-53页 |
·mimic组结果 | 第53-56页 |
·共表达分析 | 第56-68页 |
·mRNA DAVID功能富集结果 | 第56-59页 |
·mRNA pathway分析结果 | 第59-61页 |
·lncRNA与mRNA的共表达 | 第61-68页 |
·let-7e结合位点 | 第68-69页 |
·let-7e-mRNA-lncRNA的调控网络 | 第69-72页 |
·有let-7e的结合位点的mRNA | 第69-70页 |
·let-7e对内皮细胞的调控作用 | 第70-72页 |
·本章小结 | 第72-74页 |
第5章 总结与展望 | 第74-76页 |
参考文献 | 第76-80页 |
致谢 | 第80-81页 |
学位论文评阅及答辩情况表 | 第81页 |