| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-24页 |
| ·肠道微生物的研究概况 | 第10-16页 |
| ·肠道微生物群落的研究手段 | 第16-21页 |
| ·龟类动物肠道微生物研究进展 | 第21-22页 |
| ·本实验研究目的及意义 | 第22-24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-32页 |
| ·材料 | 第24-25页 |
| ·龟样品的选取及粪便的收集 | 第24页 |
| ·试剂与仪器 | 第24-25页 |
| ·方法 | 第25-32页 |
| ·肠道微生物宏基因组 DNA 的提取 | 第25-26页 |
| ·肠道微生物宏基因组 DNA 进行 PCR 扩增 | 第26页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳检测 DNA 和 PCR | 第26-27页 |
| ·454 GS FLX Titanium 测序 | 第27-28页 |
| ·生物信息学分析 | 第28-32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-53页 |
| ·肠道微生物宏基因组 DNA 的提取和质量检测 | 第32-34页 |
| ·454 测序序列数据统计 | 第34-35页 |
| ·基于 OTU（Operation Taxonomic Unit）对样品进行初步分析 | 第35-37页 |
| ·红耳龟和四眼斑水龟肠道微生物多样性分析 | 第37-38页 |
| ·红耳龟和四眼斑水龟肠道菌群结构组成分析 | 第38-48页 |
| ·红耳龟和四眼斑水龟的肠道菌群差异性分析 | 第48-49页 |
| ·基于基因型分析红耳龟和四眼斑水龟的肠道病原菌 | 第49-53页 |
| 4 讨论 | 第53-58页 |
| ·16S rRNA 基因扩增片段的选取 | 第53页 |
| ·Roche 454 焦磷酸测序方法 | 第53-54页 |
| ·红耳龟和四眼斑水龟样本肠道微生物群落结构组成 | 第54-55页 |
| ·红耳龟和四眼斑水龟肠道菌群差异性分析 | 第55-56页 |
| ·肠道病原菌的比较分析 | 第56-58页 |
| 5 结论 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-70页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第70-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 附件 | 第72页 |