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巨桉ZFP家族基因克隆和表达分析及EgrZFP1的调控因子筛选

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-7页
目录第7-11页
引言第11-12页
第一章 文献综述第12-24页
   ·植物抵御非生物胁迫的分子机制研究现状第12-18页
     ·低温胁迫及其转录级联反应第12-15页
       ·依赖 CBF 的应答途径:ICE-CBF-COR 转录途径第12-15页
       ·非 CBF 依赖型途径第15页
     ·盐胁迫和离子信号第15-16页
     ·干旱胁迫和渗透信号第16-18页
       ·ABA 非依赖型调控机制第16页
       ·ABA 依赖型调控机制第16-17页
       ·逆境适应下信号传导交联机制第17-18页
   ·植物 C2H2 型锌指蛋白研究进展第18-20页
     ·C2H2 型锌指蛋白的结构特点和功能区第18-19页
     ·C2H2 型锌指蛋白的功能第19-20页
       ·C2H2 型锌指蛋白参与调控之物的生长发育第19页
       ·C2H2 型锌指蛋白参与植物抗逆反应第19-20页
   ·顺式作用元件及转录因子的研究方法第20-22页
     ·生物信息学分析与预测第20-21页
     ·突变分析法第21页
     ·凝胶阻滞法第21页
     ·DNase I 足迹法第21页
     ·酵母单杂交体系第21-22页
   ·技术路线第22-24页
第二章 巨桉 C2H2 型锌指蛋白基因 ZFP 家族的克隆第24-36页
   ·材料与方法第24-30页
     ·材料第24页
     ·试剂第24页
     ·仪器第24页
     ·桉树总 RNA 的提取第24页
     ·琼脂糖凝胶电泳检测 RNA第24-25页
     ·反转录 cDNA 第一链的合成第25-26页
     ·目的基因全长 cDNA 的分离第26-30页
       ·中间片段的扩增:第26-28页
       ·5 ' RACE 及 3' RACE第28页
       ·ZFP 序列的验证第28-29页
       ·凝胶回收第29页
       ·连接反应第29页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备及转化第29-30页
       ·序列测定第30页
       ·序列比较和分析第30页
   ·结果与分析第30-34页
     ·EgrZFP 基因的克隆第30-31页
     ·EgrZFP 蛋白的序列分析第31-34页
   ·讨论第34-36页
第三章 巨桉 EgrZFP 基因家族的表达分析第36-43页
   ·材料与方法第36-38页
     ·实验材料第36页
     ·试剂第36页
     ·材料的处理第36页
     ·总 RNA 的提取第36页
     ·EgrZFP 基因组织特异性表达分析第36-38页
     ·冷处理第38页
     ·ABA、干旱和盐处理第38页
     ·实时荧光定量 RT-PCR第38页
   ·结果与分析第38-41页
     ·巨桉不同器官中 EgrZFP1-7 的表达分析第38-39页
     ·EgrZFP1-7 在非生物胁迫下的表达分析第39-41页
   ·讨论第41-43页
第四章 酵母单杂交 cDNA 文库构建第43-53页
   ·材料与方法第43-49页
     ·材料第43页
     ·试剂第43页
     ·仪器第43页
     ·Total RNA 的提取第43页
     ·mRNA 的分离第43-44页
     ·cDNA 文库的构建第44-48页
       ·cDNA 第一链的合成第44页
       ·cDNA 第二链的合成第44-45页
       ·cDNA 与三框 attB1 重组接头连接第45页
       ·cDNA 分级分离及收集第45-46页
       ·BP 重组反应第46页
       ·电转化大肠杆菌 DH10B第46-47页
       ·cDNA 文库(Uncut 型)文库质量鉴定第47-48页
     ·酵母单杂交 cDNA 文库的构建第48-49页
       ·Uncut 文库的质粒抽提第48页
       ·文库质粒重组第48页
       ·电转化大肠杆菌 DH10B第48-49页
       ·酵母单杂交 cDNA 文库质量鉴定第49页
   ·结果与分析第49-52页
     ·总 RNA 质量检测第49-50页
     ·mRNA 的分离第50页
     ·初级 cDNA 文库质量检测第50-51页
       ·初级文库的库容量鉴定第50-51页
       ·重组率和插入片段长度鉴定第51页
     ·酵母单杂交文库质量检测第51-52页
       ·酵母单杂交文库的库容量鉴定第51-52页
       ·重组率和插入片段长度鉴定第52页
   ·讨论第52-53页
第五章 酵母单杂交系统筛选 EgrZFP1 的转录因子第53-69页
   ·材料与方法第53-62页
     ·实验试剂第53页
     ·启动子序列克隆及顺式作用元件分析第53-54页
       ·启动子序列克隆第53-54页
       ·启动子序列的验证第54页
       ·启动子中瞬时作用元件分析第54页
     ·获得 Bait-pAbAi 质粒第54-56页
       ·克隆得到 200bp 左右的启动子片段第54-55页
       ·重组得到 Bait-pAbAi 质粒第55-56页
     ·获取 Bait 酵母菌株第56-59页
       ·YPDA 培养基配制第56-57页
       ·酵母感受态细胞的制备第57页
       ·线性化 Bait-pAbAi 质粒第57-58页
       ·配制 PEG/LiAc 溶液第58页
       ·变性 Yeastmaker Carrier DNA第58页
       ·转化酵母感受态细胞第58页
       ·酵母菌液 PCR第58-59页
     ·Bait 菌株的自激活检测第59页
     ·转酵母单杂交文库质粒到 Bait 菌株中第59-60页
       ·用 Bait 菌株制备酵母感受态第59-60页
       ·变性 Yeastmaker Carrier DNA第60页
       ·转化酵母感受态细胞第60页
     ·筛选出的克隆的阳性分析第60-61页
       ·进一步验证酵母单克隆阳性第60页
       ·提取酵母中的 PGADT7 质粒第60-61页
       ·将提取的 PGADT7 质粒转入大肠杆菌中第61页
       ·测序第61页
     ·筛选出的阳性克隆功能分析第61-62页
       ·测序结果分析第61页
       ·实时荧光定量 PCR 筛选的基因低温下的表达分析第61-62页
   ·结果与分析第62-67页
     ·EgrZFP1 的启动子分析第62-63页
       ·EgrZFP1 的启动子克隆检测第62页
       ·顺式作用元件分析第62-63页
     ·Bait 菌株构建分析第63-64页
       ·200 bp 启动子片段克隆结果分析第63页
       ·酵母菌液 PCR 检测 Bait 菌株第63-64页
     ·Bait 菌株自激活检测分析第64页
     ·文库筛选结果分析第64-66页
     ·筛选出的基因的表达分析第66-67页
   ·讨论第67-69页
第六章 结论第69-70页
参考文献第70-77页
附录第77-79页
个人简介第79-80页
致谢第80页

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