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犊牛腹泻病原体沙门氏菌与BVD病毒LAMP检测体系的优化与初步应用

致谢第4-9页
摘要第9-11页
文献综述第11-24页
    1 环介导恒温扩增技术基本介绍第11-19页
        1.1 LAMP技术引物介绍第11-12页
        1.2 LAMP引物的设计第12-13页
            1.2.1 引物间的距离以及引物大小第12页
            1.2.2 引物的Tm值第12页
            1.2.3 引物碱基含量第12页
            1.2.4 引物末端稳定性第12-13页
            1.2.5 二级结构第13页
        1.3 LAMP技术的扩增原理第13-15页
            1.3.1 循环模板的合成第13-14页
            1.3.2 循环扩增阶段第14-15页
            1.3.3 伸长与再循环阶段第15页
        1.4 LAMP方法的特点第15-16页
        1.5 经典LAMP体系的建立第16页
        1.6 LAMP扩增产物可视化检测第16-19页
            1.6.1 沉淀观测法第17页
            1.6.2 显色观察法第17-18页
            1.6.3 凝胶电泳观察法第18-19页
    2 LAMP病原体检测在国内外的应用第19-23页
        2.1 细菌的检测第19-20页
        2.2 病毒的检测第20-21页
        2.3 寄生虫的检测第21-22页
        2.4 胚胎性别鉴定方面的应用第22页
        2.5 LAMP在其他方面的应用第22-23页
    3 小结第23-24页
引言第24-25页
试验一 犊牛腹泻沙门氏菌LAMP检测体系的优化第25-40页
    1 材料与方法第25-32页
        1.1 试验材料第25-26页
            1.1.1 菌液第25页
            1.1.2 主要试剂和仪器第25-26页
        1.2 试验方法第26-27页
            1.2.1 菌种的处理第26页
            1.2.2 细菌DNA模板的处理第26-27页
        1.3 LAMP反应和PCR反应的建立第27-32页
            1.3.1 LAMP引物设计第27-28页
            1.3.2 经典LAMP体系和PCR体系的建立第28-30页
            1.3.3 LAMP反应体系的优化第30-31页
                1.3.3.1 反应温度的优化第30页
                1.3.3.2 Mg2+浓度的优化第30页
                1.3.3.3 dNTPs浓度的优化第30-31页
                1.3.3.4 Bst酶浓度的优化第31页
                1.3.3.5 内外引物浓度比的优化第31页
                1.3.3.6 LAMP特异性检测第31页
                1.3.3.7 LAMP灵敏度检测第31页
            1.3.4 LAMP扩增产物的分析第31-32页
                1.3.4.1 白色沉淀法第31页
                1.3.4.2 SYBR Green I染色法第31页
                1.3.4.3 琼脂糖凝胶电泳法第31-32页
    2 结果与分析第32-36页
        2.1 LAMP反应体系的优化结果与分析第32-36页
            2.1.1 LAMP反应温度的优化第32页
            2.1.2 LAMP镁离子浓度的优化第32-33页
            2.1.3 LAMP DntpS浓度的优化第33页
            2.1.4 LMAP Bst聚合酶浓度的优化第33-34页
            2.1.5 LAMP内外引物浓度比的优化第34-35页
            2.1.6 LAMP沙门氏菌特异性检测第35页
            2.1.7 LAMP沙门氏菌灵敏度检测第35-36页
    3 讨论第36-38页
        3.1 建立LAMP体系时出现的问题第36-37页
        3.2 LAMP最优反应体系的确立第37-38页
        3.3 LAMP可视化检测方法的比较第38页
    4 小结第38-40页
试验二 犊牛腹泻BVD病毒RT-LAMP检测体系的优化第40-51页
    1 实验材料第40-41页
        1.1 病料采集第40-41页
        1.2 主要试剂和仪器第41页
    2 试验方法第41-45页
        2.1 病料的处理第41页
        2.2 毒液RNA的提取第41-42页
        2.3 BVD病毒RT-LAMP检测体系和RT-PCR体系的建立及优化第42-45页
            2.3.1 引物设计第42页
            2.3.2 经典RT-LAMP体系和RT-PCR体系的建立第42-44页
            2.3.3 RT-LAMP反应体系的优化第44-45页
                2.3.3.1 RT-LAMP扩增体系组分的优化第44页
                2.3.3.2 RT-LAMP特异性检测第44-45页
                2.3.3.3 RT-LAMP灵敏度检测第45页
                2.3.3.4 反应温度的优化第45页
            2.3.4 LAMP扩增产物的分析第45页
    3 结果与分析第45-49页
        3.1 LAMP反应体系的优化第45-49页
            3.1.1 LAMP反应温度的优化第45页
            3.1.2 LAMP镁离子浓度的优化第45-46页
            3.1.3 LAMP dNTPs浓度的优化第46-47页
            3.1.4 LAMP Bst聚合酶浓度的优化第47页
            3.1.5 LAMP内外引物浓度比的优化第47-48页
            3.1.6 LAMP病毒性腹泻病毒特异性检测第48-49页
            3.1.7 LAMP病毒性腹泻病毒灵敏度检测第49页
    4 小结第49-51页
试验三 LAMP检测体系的初步应用第51-57页
    1 试验材料与方法第51-52页
        1.1 主要试剂和仪器第51页
        1.2 主要溶液的配置第51-52页
        1.3 样本的处理与检测第52页
    2 其他病原体LAMP检测第52页
    3 结果与分析第52-56页
    小结第56-57页
参考文献第57-64页
Abstract第64-65页

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