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计算生物学中有关基因组移位—删除排序问题的研究

摘要第1-10页
Abstract第10-12页
第一章 绪论第12-17页
   ·本文的研究背景第12-13页
   ·基因、染色体以及基因组的数学表示第13-14页
   ·基因组移位排序问题及移位-删除排序问题第14-15页
   ·本文的主要结果及创新点第15页
   ·内容安排第15-17页
第二章 理论基础第17-30页
   ·基因组排序的基本概念第17-21页
   ·Bergeron的经典移位排序算法第21-22页
   ·基因组移位排序问题O(n~2)的快速算法第22-30页
     ·最小子排列搜索算法第23-24页
     ·最右灰边第24-25页
     ·基于最右灰边的剩余子排列分段第25-27页
     ·搜索有效合理移位的顶点删除算法第27-28页
     ·搜索有效合理移位算法第28-29页
     ·快速移位排序算法第29-30页
第三章 基因组移位-删除问题第30-35页
   ·基因组移位-删除问题介绍第30页
   ·基因组移位-删除问题的形式化定义及基本移位规则第30-32页
   ·基因组移位-删除排序的时间复杂度为O(n~3)的算法第32-35页
第四章 基于O(n~2)快速移位排序的有向基因组移位-删除排序改进算法第35-41页
   ·原有基因组移位-删除排序算法中可以优化的点第35页
   ·针对不同情况的基因组移位-删除问题的处理子程序第35-38页
   ·时间复杂度的证明第38-41页
第五章 基因组移位-删除排序问题O(n~2)时间复杂度的快速算法第41-46页
   ·基因组移位-删除排序问题一种新的解决思路第41-42页
   ·基因组移位-删除排序中处理剩余最小子排列的方法第42-44页
   ·关于时间复杂度的证明第44-46页
结论第46-47页
参考文献第47-49页
致谢第49-50页
学位论文评阅及答辩情况表第50页

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