| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-14页 |
| 符号说明 | 第14-15页 |
| 第一章 前言 | 第15-32页 |
| ·铁载体的分类及依据 | 第16-17页 |
| ·关于铁载体的生物合成 | 第17-18页 |
| ·铁载体的转运系统 | 第18-25页 |
| ·TonB依赖的铁载体转运途径 | 第18-19页 |
| ·周质空间的铁载体转运 | 第19-22页 |
| ·内膜ABC转运系统 | 第22-23页 |
| ·周质空间转运蛋白与内膜ABC转运蛋白的相互作用 | 第23-24页 |
| ·铁离子在细胞内的释放 | 第24-25页 |
| ·铁载体与人体免疫系统 | 第25-26页 |
| ·霍乱弧菌和大肠杆菌的铁载体代谢途径 | 第26-30页 |
| ·弧菌素和肠菌素的合成途经 | 第26-29页 |
| ·弧菌素和肠菌素的转运途径及ViuP,FepB蛋白的重要性 | 第29页 |
| ·大肠杆菌周质空间中过量肠菌素的泄漏 | 第29-30页 |
| ·课题研究的内容和创新点 | 第30-32页 |
| 第二章 ViuP-弧菌素,FepB-肠菌素复合物的表达,纯化与结晶 | 第32-54页 |
| ·实验材料和方法 | 第32-40页 |
| ·实验材料 | 第32页 |
| ·试剂 | 第32-35页 |
| ·主要仪器设备 | 第35页 |
| ·实验方法 | 第35-40页 |
| ·实验结果 | 第40-50页 |
| ·ViuP蛋白的分离纯化 | 第40-44页 |
| ·Se-ViuP蛋白的分离与纯化 | 第44-47页 |
| ·FepB蛋白的分离与纯化 | 第47-50页 |
| ·结晶筛选和晶体的优化 | 第50-52页 |
| ·结晶方法：悬滴气相扩散法进行晶体生长 | 第50页 |
| ·ViuP、Se-ViuP蛋白的晶体生长 | 第50-51页 |
| ·ViuP-弧菌素复合物的晶体生长与优化 | 第51-52页 |
| ·FepB-肠菌素复合物的晶体生长与优化 | 第52页 |
| ·本章小结 | 第52-54页 |
| 第三章 晶体结构的解析 | 第54-72页 |
| ·衍射数据的收集与处理 | 第54-62页 |
| ·晶体衍射的原理 | 第54-56页 |
| ·衍射数据的收集及处理策略 | 第56-58页 |
| ·晶体的衍射数据处理的结果 | 第58-62页 |
| ·晶体结构“相位问题”的解决方法 | 第62页 |
| ·反常散射法确定相位问题 | 第62-65页 |
| ·基本原理 | 第62-64页 |
| ·硒代衍生蛋白反常散射波长的选择 | 第64-65页 |
| ·ViuP结构解析所用到的实验方法和数据处理结果 | 第65页 |
| ·ViuP相位求解的实施方法和结果 | 第65页 |
| ·分子置换法解决相位问题 | 第65-68页 |
| ·分子置换法的基本原理 | 第65-66页 |
| ·分子的旋转和平移(Rotation and Translation) | 第66-68页 |
| ·分子置换解决相位实施的过程和结果 | 第68页 |
| ·结构模型的修正 | 第68-72页 |
| ·结构修正的原理和方法 | 第68-69页 |
| ·结构修正的实施过程和结果 | 第69-72页 |
| 第四章 ViuP以及ViuP-弧菌素复合物晶体结构分析及功能研究 | 第72-83页 |
| ·实验材料和方法 | 第72-73页 |
| ·实验材料 | 第72页 |
| ·实验方法 | 第72-73页 |
| ·实验结果 | 第73-81页 |
| ·ViuP蛋白的晶体结构特点 | 第73-74页 |
| ·弧菌素与ViuP蛋白的结合特点 | 第74-75页 |
| ·ViuP可能来源于不同于其他铁载体结合蛋白的家族 | 第75-78页 |
| ·特殊的铁配位方式 | 第78-79页 |
| ·siderocalin能够以较低的亲和力结合带铁的弧菌素 | 第79-81页 |
| ·本章小结 | 第81-83页 |
| 第五章 FepB-肠菌素复合物的结构与功能研究 | 第83-104页 |
| ·实验材料与方法 | 第83-88页 |
| ·实验材料 | 第83页 |
| ·主要仪器设备 | 第83-84页 |
| ·实验方法 | 第84-88页 |
| ·实验结果 | 第88-101页 |
| ·FepB-肠菌素复合物的晶体结构 | 第88-89页 |
| ·FepB的底物结合特征 | 第89-91页 |
| ·FepB蛋白可能与ViuP蛋白来源于同一个蛋白家族 | 第91-92页 |
| ·FepB可能还具有储存带铁肠菌素的作用 | 第92-94页 |
| ·FepB蛋白与下游FepDG转运蛋白可能的作用模式 | 第94-97页 |
| ·FepB蛋白的C端部分对于其识别下游蛋白发挥着更重要的作用 | 第97-101页 |
| ·本章小结 | 第101-104页 |
| 第六章 参与的其他工作-STING蛋白的结构与功能研究 | 第104-108页 |
| 全文总结 | 第108-111页 |
| 附录 | 第111-113页 |
| 参考文献 | 第113-122页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第122-123页 |
| 致谢 | 第123-124页 |
| 外文写作一 | 第124-140页 |
| 外文写作二 | 第140-156页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第156页 |
