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甘蓝型油菜隐性细胞核雄性不育基因ms3的精细定位

缩略语表第1-8页
摘要第8-10页
Abstract第10-12页
1 文献综述第12-32页
   ·油菜隐性细胞核雄性不育的研究第12-17页
     ·隐性细胞核雄性不育的应用研究第13页
     ·隐性细胞核雄性不育基因的定位第13-15页
     ·隐性细胞核雄性不育的机理研究第15-17页
       ·隐性细胞核雄性不育的细胞学研究第15-16页
       ·隐性细胞核雄性不育的分子机理研究第16-17页
   ·质量性状精细定位的分子标记第17-23页
     ·特异引物PCR标记的来源途径第18-20页
       ·分子标记开发的直接途径第18-19页
       ·分子标记开发的间接途径第19-20页
     ·特异引物PCR标记的类型第20-23页
       ·SCAR标记第20-21页
       ·SSR标记第21页
       ·STS标记第21-22页
       ·一种新型的分子标记——扩增共有序列遗传标记第22-23页
   ·植物基因分离中的图位克隆技术第23-32页
     ·图位克隆的原理与技术环节第23-24页
     ·图位克隆中的关键点及应对措施第24-25页
     ·图位克隆技术的新发展和新策略第25-28页
     ·大基因组植物应用图位克隆策略的局限性第28-29页
     ·大基因组植物中的图位克隆策略第29-32页
2 本研究的目的和意义第32-33页
3 材料与方法第33-41页
   ·实验材料第33页
   ·BSA与AFLP分析第33-34页
     ·样品采集及DNA提取第33页
     ·单株育性调查第33-34页
     ·DNA混合池的构建第34页
     ·AFLP分析第34页
   ·AFLP标记的克隆、测序及分析第34-36页
     ·差异片段的回收第34-35页
     ·连接反应第35页
     ·感受态细胞的制备及转化第35页
     ·重组子的筛选、鉴定第35页
     ·测序序列分析及比对第35-36页
   ·AFLP标记的SCAR转化第36-37页
     ·直接转化法第36页
     ·间接转化法第36-37页
       ·PCR-walking分离侧翼序列第36页
       ·比较测序第36-37页
   ·ms3基因的精细定位及遗传图谱的绘制第37页
   ·ms3位点连锁标记与拟南芥基因组序列的相似性分析第37页
   ·ACGM标记的开发第37-38页
   ·BAC文库的筛选第38-39页
     ·探针制备第38页
     ·Southern杂交第38页
     ·杂交信号的读取第38页
     ·BAC克隆的阳性验证第38-39页
   ·BAC克隆间重叠关系的确定第39-40页
     ·BAC克隆质粒的抽提第39页
     ·质粒的酶切、转膜、探针制备及Southern杂交第39页
     ·BAC克隆重叠群的构建第39-40页
   ·BAC克隆的测序第40-41页
     ·BAC克隆亚克隆文库的构建第40页
     ·亚克隆片段的测序第40-41页
4 结果与分析第41-60页
   ·定位群体单株的育性调查第41页
   ·AFLP标记的筛选第41-43页
   ·AFLP标记差异片段的回收、测序和SCAR转化第43-48页
     ·直接源于AFLP序列的SCAR标记第43-44页
     ·依据AFLP标记侧翼序列的SCAR标记第44-46页
       ·标记侧翼序列的PCR-Walking分离第44-46页
       ·依据侧翼序列的SCAR标记转化第46页
     ·基于比较测序的SCAR标记第46-48页
   ·目标位点连锁标记与拟南芥序列的同源性BLAST第48-49页
   ·ms3基因的精细遗传定位第49-51页
   ·目标基因区域遗传距离的进一步缩小第51-54页
     ·基于序列同源性比较的ACGM标记的开发第52-53页
     ·ACGM标记在交换单株中的分析第53-54页
   ·Tapiaor BAC文库的筛选及BAC克隆的阳性验证第54-56页
   ·含有ms3基因的BAC重叠群的确定第56-58页
   ·BAC克隆O的亚克隆文库的构建、测序第58-60页
5 讨论第60-69页
   ·与目标基因连锁更紧密标记的筛选第60页
   ·SCAR标记的转化第60-62页
   ·基于共线性比较的ACGM标记的开发第62-64页
   ·ms3基因定位结果的比较分析第64-66页
   ·研究中物理距离与遗传距离的对应关系问题第66-67页
   ·进一步精细定位ms3基因的设想第67-69页
参考文献第69-83页
附录:部分实验的详细操作步骤第83-86页
致谢第86页

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