| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-9页 |
| 第一章 计算机辅助药物设计概论 | 第9-18页 |
| ·引言 | 第9-10页 |
| ·药物先导化合物的发现 | 第10-12页 |
| ·计算机辅助药物设计的策略 | 第12-15页 |
| ·以受体的三维结构为基础的药物设计 | 第14页 |
| ·在药物小分子构效关系基础上的药物设计 | 第14页 |
| ·与组合化学相对应的计算机辅助药物设计 | 第14-15页 |
| ·结语 | 第15-16页 |
| 参考文献 | 第16-18页 |
| 第二章 α-葡萄糖苷酶与穿心莲内酯类化合物 | 第18-29页 |
| ·α-葡萄糖苷酶 | 第18页 |
| ·穿心莲内酯及其衍生物 | 第18-23页 |
| ·穿心莲化学成分研究 | 第19页 |
| ·穿心莲内酯及其衍生物的药理作用 | 第19-23页 |
| ·本课题的研究思路 | 第23-24页 |
| 参考文献 | 第24-29页 |
| 第三章 α-葡萄糖苷酶三维结构的同源模建 | 第29-42页 |
| ·概述 | 第29-30页 |
| ·材料与方法 | 第30-34页 |
| ·α-葡萄糖苷酶序列的确定 | 第30-31页 |
| ·序列联配和同源蛋白的确定 | 第31-34页 |
| ·BLASTp对 SWISS-PORT蛋白序列数据库搜索结果 | 第31-32页 |
| ·BLASTp对布鲁克海文 PDB蛋白结构数据库搜索的结果 | 第32-33页 |
| ·序列分析 | 第33-34页 |
| ·α-葡萄糖苷酶三维结构模建和动力学优化 | 第34页 |
| ·结果与讨论 | 第34-39页 |
| ·三维结构的总体特征 | 第34-35页 |
| ·三维模型的可靠性分析 | 第35-36页 |
| ·α-葡萄糖苷酶的活性位点分析 | 第36-39页 |
| ·模板蛋白活性位点分析 | 第36-37页 |
| ·α-葡萄糖苷酶活性位点分析 | 第37-39页 |
| ·结论 | 第39-40页 |
| 参考文献 | 第40-42页 |
| 第四章 新型α-葡萄糖苷酶抑制剂的分子对接研究 | 第42-63页 |
| ·概述 | 第42-43页 |
| ·α-葡萄糖苷酶与抑制剂的柔性对接 | 第43-45页 |
| ·利用 Cerius~2进行的柔性对接 | 第43-44页 |
| ·利用 Insight II进行的柔性对接 | 第44-45页 |
| ·结果与讨论 | 第45-61页 |
| ·配体小分子的构象搜索 | 第45页 |
| ·α-葡萄糖苷酶与抑制剂的柔性对接结果分析 | 第45-61页 |
| ·Cerius~2柔性对接结果分析 | 第45-55页 |
| ·Insight II柔性对接结果分析 | 第55-61页 |
| ·分子对接结论 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-63页 |
| 第五章 新型α-葡萄糖苷酶抑制剂的3D-QSAR研究 | 第63-74页 |
| ·概述 | 第63-66页 |
| ·分子力场方法(MFA) | 第64页 |
| ·用于3D-QSAR的生物活性数据 | 第64-65页 |
| ·用于3D-QSAR的模型评价 | 第65-66页 |
| ·材料与方法 | 第66-67页 |
| ·穿心莲内酯类化合物3D-QSAR的研究步骤 | 第66页 |
| ·配体药效构象的选择 | 第66页 |
| ·MEA模型的建立 | 第66-67页 |
| ·3D-QSAR的结果分析 | 第67-71页 |
| 参考文献 | 第71-74页 |
| 第六章 Glycosyl hydrolase13蛋白质家族的进化踪迹分析 | 第74-79页 |
| ·进化踪迹分析原理 | 第74-75页 |
| ·材料与方法 | 第75-76页 |
| ·结果与讨论 | 第76-78页 |
| ·多元序列匹配与进化树构建 | 第76-77页 |
| ·活性位点的踪迹残基识别 | 第77页 |
| ·α-葡萄糖苷酶活性位点的潜在药物结合位点 | 第77-78页 |
| ·结论 | 第78页 |
| 参考文献 | 第78-79页 |
| 第七章 结论 | 第79-81页 |
| 附录:攻读硕士期间发表及待发表论文 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
