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天蓝色链霉菌离子通道蛋白MscL及胁迫调节因子SigN的生物学功能

摘要第1-6页
Abstract第6-9页
目录第9-13页
第一章 绪论第13-33页
   ·前言第13-14页
   ·机械敏感性离子通道的研究进展第14-22页
     ·机械敏感性离子通道的进化起源第14-17页
     ·MS通道的分类第17-18页
     ·MscL离子通道的进化与结构第18-20页
     ·MscL的特点和功能第20-21页
     ·MscL的门控机制第21-22页
   ·天蓝色链霉菌中胁迫调节相关σ因子的研究进展第22-30页
     ·S.coelicolor的胁迫调节相关σ因子第25-28页
     ·S.coelicolor的anti-sigma factor第28-29页
     ·σ因子的调控基因第29-30页
   ·研究内容第30-33页
第二章 材料和方法第33-61页
   ·菌种培养第33-37页
     ·P-buffer第33页
     ·YEME(Yeast extract-malt extract)培养基第33-34页
     ·R_5平板和R_5~-液体培养基第34-35页
     ·微量元素储存液(Trace element solution,TES)第35页
     ·TSB培养基第35页
     ·2×YT培养基第35页
     ·孢子悬液制备第35-36页
     ·菌落观察及其扫描电镜观察第36页
     ·S.coelicolor原生质体制备第36-37页
     ·抗生素测定第37页
   ·基因操作第37-44页
     ·S.coelicolor基因组提取第37-38页
     ·链霉菌原生质体的转化(快速小量法)第38页
     ·基因敲除和突变株筛选第38-39页
     ·回复突变体构建第39-40页
     ·主要PCR程序第40-41页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第41页
     ·大肠杆菌感受态细胞的转化第41-42页
     ·大肠杆菌质粒提取及其DNA片断回收第42页
     ·Southern blot试验操作第42-44页
   ·大肠杆菌中蛋白表达和纯化第44-47页
     ·大肠杆菌中表达目的蛋白第44页
     ·大肠杆菌中目的蛋白表达形式的鉴定第44页
     ·大肠杆菌中表达蛋白的纯化第44-47页
   ·细胞生物学技术第47-51页
     ·Top10感受态细胞的制备第47-49页
     ·Top10感受态细胞的转化第49页
     ·质粒提取第49页
     ·细胞培养基本操作(以贴壁细胞为例)第49-50页
     ·脂质体中介的细胞转染(以24孔细胞培养板为例)第50-51页
   ·蛋白相互作用研究技术第51-54页
     ·Pull down技术第52页
     ·体内pull-down第52-53页
     ·细胞免疫荧光共定位技术第53-54页
     ·哺乳动物细胞双杂交第54页
   ·基因调控研究技术第54-61页
     ·双向电泳(2-DE)第54-56页
     ·转录水平上的分析技术第56-61页
第三章 渗透压胁迫条件下S.coelicolor生理反应研究第61-79页
   ·引言第61-62页
   ·材料和方法第62-68页
     ·菌株及其培养第62页
     ·试验方法第62-68页
   ·结果和分析第68-77页
     ·不同溶质低渗胁迫对S.coelicolor M145的存活率的影响第68-69页
     ·NaCl低渗胁迫时间对S.coelicolor M145的存活率的影响第69-70页
     ·NaCl低渗胁迫浓度梯度对S.coelicolor M145的存活率的影响第70-73页
     ·NaCl低渗胁迫梯度对S.coelicolor的细胞相容性物质的影响第73-77页
   ·讨论和小结第77-79页
第四章 S.coelicolor中机械敏感性离子通道MscL的生化特性和生理功能研究第79-105页
   ·引言第79-80页
   ·材料和方法第80-88页
     ·菌种和载体第80页
     ·主要试剂第80-83页
     ·主要仪器第83页
     ·试验操作第83-88页
   ·结果与分析第88-103页
     ·Sc-MscL功能的生物信息学分析第88-90页
     ·pKC-mlkmr构建过程第90-91页
     ·Sc-mscl缺失突变体W2006的PCR鉴定和southern blot鉴定第91-92页
     ·回复突变体的构建第92-94页
     ·突变体W2006、野生型M145和回复突变体的形态发育对照第94页
     ·scmscl缺失突变体W2006和野生型M145对抗低渗胁迫的反应对照第94-96页
     ·scmscl缺失突变体W2006和野生型M145次生代谢对照第96页
     ·scmscl基因的获得第96页
     ·表达质粒的酶切鉴定第96-98页
     ·表达质粒pGEX-Scmscl的测序鉴定第98页
     ·体外表达GST-ScMscL和His-ScMscL第98页
     ·体外表达形式的鉴定第98-99页
     ·表达蛋白的纯化及其凝血酶酶切获得单一的Sc-MscL蛋白第99-100页
     ·Cross-linking试验探索ScMscL的功能聚合体第100-101页
     ·体内表达ScMscL的western blot验证第101页
     ·体内过量表达ScMscL对菌体生长和抗生素合成的影响第101-103页
   ·讨论与小结第103-105页
第五章 SigN对S.coelicolor形态发育及其胁迫调节作用的研究第105-119页
   ·引言第105-106页
   ·研究靶标SigN的确定第106-108页
     ·利用B.subtilis的SigB对S.coelicolor的基因组进行搜索比对研究第106页
     ·SigN生物信息分析第106-108页
   ·材料与方法第108-110页
     ·菌种和载体第108页
     ·主要试剂和操作步骤第108页
     ·引物和质粒构建第108-110页
     ·sigN缺失突变体及其sigN回复突变体构建策略第110页
     ·胁迫条件培养基的配制第110页
   ·结果与讨论第110-117页
     ·SigN缺失突变体的构建第110-114页
     ·SigN缺失对S.coelicolor的生长及其次级代谢的影响第114-117页
   ·讨论与小结第117-119页
第六章 SigN的分子调控机制研究第119-151页
   ·引言第119-120页
   ·材料和方法第120-126页
     ·菌株和质粒第120页
     ·引物第120页
     ·质粒构建第120-123页
     ·试验方法第123-126页
   ·结果与分析第126-149页
     ·sigN,SCO5373的PCR及其表达质粒的构建第126-128页
     ·In vivo pull down结合质谱测定分析与SigN相互作用的蛋白第128-129页
     ·荧光共定位第129页
     ·哺乳动物双杂交第129-131页
     ·In vitro pull down分析第131-132页
     ·胞内ATP水平分析第132-133页
     ·S.coelicolor基因组酶切第133页
     ·体外结合片段的获取第133-134页
     ·生物信息学分析127个片段获得24个潜在的启动子序列第134-136页
     ·24个潜在启动子的体外进一步验证第136-137页
     ·RT-PCR结果第137-138页
     ·双向电泳差异点分析第138-145页
     ·RT-PCR验证调控基因第145-148页
     ·Northern blot结果第148-149页
   ·讨论和小结第149-151页
结论与展望第151-154页
 (1)天蓝色链霉菌的渗透压胁迫反应调节特性的研究第151页
 (2)Sc-MscL对天蓝色链霉菌形态发育和次级代谢的调节作用第151-152页
 (3)σ~N对天蓝色链霉菌的形态发育、次级代谢和胁迫反应应答的功能研究第152页
 (4)σ~N的相互作用蛋白研究第152页
 (5)σ~N的调控靶基因和间接调控的基因网络研究第152-154页
缩略表第154-155页
参考文献第155-162页
附录第162-171页
攻读学位期间发表的学术论文第171-172页
致谢第172页

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