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用Real Time PCR和DGGE技术研究放牧藏系绵羊瘤胃微生物季节动态

致谢第1-5页
中文摘要第5-7页
ABSTRACT第7-15页
前言第15-17页
第一篇 文献综述第17-37页
 第一章 瘤胃微生物的种类及特点第17-20页
   ·细菌的特点及其在瘤胃发酵中的作用第17-18页
     ·产甲烷菌的特点及其在瘤胃发酵中的作用第17-18页
     ·琥珀酸丝状杆菌的特点及其在瘤胃发酵中的作用第18页
   ·真菌的特点及其在瘤胃发酵中的作用第18-19页
   ·瘤胃原虫的特点及其在瘤胃发酵中的作用第19-20页
 第二章 微生物间的相互关系第20-21页
 第三章 影响瘤胃微生物数量的因素第21-24页
   ·年龄因素第21页
   ·动物品种第21-22页
   ·饲料供给技术第22-23页
   ·采食水平第23页
   ·季节与地域影响第23-24页
 第四章 瘤胃微生物的定量研究方法第24-33页
   ·传统定量方法第24-25页
     ·稀释平板计数法第24-25页
     ·最大或然数法第25页
   ·传统瘤胃微生物定量方法的缺点第25-26页
   ·分子生物学定量方法第26-33页
     ·点杂交和狭线杂交第26-27页
     ·变性(或温度)梯度凝胶电泳第27页
     ·定量PCR 技术第27-33页
       ·竞争定量PCR第28页
       ·Real Time-PCR第28-31页
         ·Real Time-PCR 的原理第29页
         ·荧光标记法种类第29-30页
         ·双链DNA 结合染料第30页
         ·分子信标(molecular beacon)第30页
         ·杂交探针第30-31页
         ·TaqMan 探针第31页
       ·定量方法第31-33页
         ·Ct (threshold cycle)第31页
         ·标准曲线制作及未知样品的定量第31-32页
         ·Real Time-PCR 优点第32页
         ·Real Time-PCR 在瘤胃微生物研究中的应用第32-33页
 第五章 瘤胃微生物多样性研究方法第33-37页
   ·直接测定微生物16S rRNA 序列第33-34页
   ·单链构象多态性分析(SSCP)第34页
   ·限制性酶切片段长度多态性分析(RFLP)第34页
   ·特异RNA 探针杂交第34-35页
   ·DGGE 技术第35-37页
     ·DGGE 技术在瘤胃微生物群落研究中的应用第35页
     ·DGGE 技术的优点第35-37页
第二篇 试验研究第37-99页
 第一章 放牧地牧草营养分成的季节变化第37-46页
  前言第37页
  1 材料与方法第37-41页
   ·试验时间与地点第37-38页
   ·试验地概况第38-39页
   ·试验羊放牧地主要植物群落类群及其分布特征第39页
   ·植物样品的采集与测定第39-40页
   ·尼龙袋法试验第40页
     ·尼龙袋的投放第40页
     ·尼龙袋处理第40页
     ·各营养成分消失率计算第40页
   ·放牧采食量的测定第40-41页
   ·放牧藏系绵羊瘤胃pH 值测定第41页
   ·样品处理及分析第41页
   ·统计方法第41页
  2 结果第41-43页
   ·牧草的营养成分含量及营养价值第41-42页
   ·放牧绵羊采食量和消化率动态第42页
   ·不同季节放牧绵羊瘤胃pH 值第42-43页
  3 讨论第43-45页
   ·季节对牧草的营养成分含量及营养价值的影响第43页
   ·季节对放牧绵羊采食量和消化率影响第43-45页
  4 小结第45-46页
 第二章 藏系绵羊瘤胃微生物总DNA 的提取第46-54页
  前言第46页
  1 材料与方法第46-50页
   ·材料第46-47页
     ·藏系绵羊瘤胃内容物第46页
     ·生化试剂第46-47页
     ·主要仪器第47页
     ·主要分子生物试剂配制第47页
     ·引物第47页
   ·方法第47-50页
     ·瘤胃内容物的采集与处理第48页
     ·DNA 提取方法第48页
     ·DNA 的纯化第48-49页
     ·DNA 提取质量检测第49-50页
  2 结果分析第50-52页
   ·瘤胃微生物DNA 的提取第50-51页
   ·瘤胃微生物总DNA 的纯化第51-52页
  3 讨论第52页
  4 小结第52-54页
 第三章 用Real time-PCR 技术研究藏系绵羊瘤胃微生物季节变化第54-84页
  前言第54-55页
  1 材料与方法第55-61页
   ·材料第55-56页
   ·方法第56-61页
     ·Real-time PCR 定量检测不同季节瘤胃总细菌第56-58页
     ·Real-time PCR 定量检测不同季节瘤胃产甲烷菌总量第58-60页
     ·Real-time PCR 定量检测不同季节瘤胃真菌总量第60-61页
     ·Real-time PCR 定量检测不同季节瘤胃琥珀酸丝状杆菌总量第61页
   ·数据统计与分析第61页
  2 结果第61-74页
   ·瘤胃细菌16S rDNA Real Time PCR第61-66页
     ·瘤胃细菌16S rDNA Real Time PCR 标准曲线制作第61页
     ·模板浓度优化第61-63页
     ·瘤胃细菌Real Time PCR 标准曲线第63-64页
     ·不同季节藏系绵羊瘤胃细菌Real Time PCR 的定量第64-66页
   ·Real Time PCR 定量检测不同季节藏系绵羊瘤胃产甲烷菌第66-69页
     ·瘤胃产甲烷菌Real Time PCR 标准曲线第66-67页
     ·不同季节藏系绵羊瘤胃产甲烷菌Real Time PCR 的定量第67-69页
   ·Real Time PCR 定量检测不同季节藏系绵羊瘤胃真菌第69-71页
     ·瘤胃真菌Real Time PCR 标准曲线第69-70页
     ·不同季节藏系绵羊瘤胃真菌Real Time PCR 的定量第70-71页
   ·Real Time PCR 定量检测不同季节藏系绵羊瘤胃琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)第71-74页
     ·标准曲线第71-73页
     ·不同季节藏系绵羊瘤胃琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)Real Time PCR 的定量第73-74页
  3 讨论第74-83页
   ·标准曲线的制备第74-75页
   ·季节变化对藏系绵羊瘤胃微生物数量的影响第75-81页
     ·季节变化对藏系绵羊瘤胃细菌数量的影响第76-78页
     ·季节变化对藏系绵羊瘤胃产甲烷菌数量的影响第78-80页
     ·季节变化对藏系绵羊瘤胃真菌数量的影响第80-81页
     ·季节变化对藏系绵羊瘤胃琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)数量的影响第81页
   ·微生物之间的相互作用第81-83页
  4 小结第83-84页
 第四章 变性梯度凝胶电泳法研究藏系绵羊瘤胃微生物季节变化第84-97页
  前言第84-85页
  1 材料与方法第85-88页
   ·材料第85页
   ·方法第85-88页
   ·计算机分析第88页
  2 结果与分析第88-93页
   ·不同季节藏系绵羊瘤胃细菌DGGE 图谱分析第88-89页
   ·不同季节瘤胃细菌区系DGGE 图谱相似性分析第89-90页
   ·不同季节瘤胃细菌群体变化规律第90-91页
   ·不同季节藏系绵羊瘤胃细菌多样性分析第91页
   ·不同季节藏系绵羊瘤胃古细菌DGGE 图谱分析第91页
   ·不同季节瘤胃古细菌区系DGGE 图谱相似性分析第91-93页
   ·不同季节藏系绵羊瘤胃古细菌多样性分析第93页
  3 讨论第93-96页
   ·季节对瘤胃细菌的影响第93-95页
   ·季节对瘤胃古细菌的影响第95页
   ·微生物之间的相互作用对细菌和古细菌多样性的影响第95-96页
  4 小结第96-97页
 第五章 总结论第97-98页
 第六章 论文创新点及需进一步研究的问题第98-99页
  创新点第98页
  需进一步研究的问题第98-99页
主要参考文献第99-112页
个人简介第112页
在学期间发表的文章第112-114页
导师简介第114页

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