致谢 | 第1-5页 |
中文摘要 | 第5-7页 |
ABSTRACT | 第7-15页 |
前言 | 第15-17页 |
第一篇 文献综述 | 第17-37页 |
第一章 瘤胃微生物的种类及特点 | 第17-20页 |
·细菌的特点及其在瘤胃发酵中的作用 | 第17-18页 |
·产甲烷菌的特点及其在瘤胃发酵中的作用 | 第17-18页 |
·琥珀酸丝状杆菌的特点及其在瘤胃发酵中的作用 | 第18页 |
·真菌的特点及其在瘤胃发酵中的作用 | 第18-19页 |
·瘤胃原虫的特点及其在瘤胃发酵中的作用 | 第19-20页 |
第二章 微生物间的相互关系 | 第20-21页 |
第三章 影响瘤胃微生物数量的因素 | 第21-24页 |
·年龄因素 | 第21页 |
·动物品种 | 第21-22页 |
·饲料供给技术 | 第22-23页 |
·采食水平 | 第23页 |
·季节与地域影响 | 第23-24页 |
第四章 瘤胃微生物的定量研究方法 | 第24-33页 |
·传统定量方法 | 第24-25页 |
·稀释平板计数法 | 第24-25页 |
·最大或然数法 | 第25页 |
·传统瘤胃微生物定量方法的缺点 | 第25-26页 |
·分子生物学定量方法 | 第26-33页 |
·点杂交和狭线杂交 | 第26-27页 |
·变性(或温度)梯度凝胶电泳 | 第27页 |
·定量PCR 技术 | 第27-33页 |
·竞争定量PCR | 第28页 |
·Real Time-PCR | 第28-31页 |
·Real Time-PCR 的原理 | 第29页 |
·荧光标记法种类 | 第29-30页 |
·双链DNA 结合染料 | 第30页 |
·分子信标(molecular beacon) | 第30页 |
·杂交探针 | 第30-31页 |
·TaqMan 探针 | 第31页 |
·定量方法 | 第31-33页 |
·Ct (threshold cycle) | 第31页 |
·标准曲线制作及未知样品的定量 | 第31-32页 |
·Real Time-PCR 优点 | 第32页 |
·Real Time-PCR 在瘤胃微生物研究中的应用 | 第32-33页 |
第五章 瘤胃微生物多样性研究方法 | 第33-37页 |
·直接测定微生物16S rRNA 序列 | 第33-34页 |
·单链构象多态性分析(SSCP) | 第34页 |
·限制性酶切片段长度多态性分析(RFLP) | 第34页 |
·特异RNA 探针杂交 | 第34-35页 |
·DGGE 技术 | 第35-37页 |
·DGGE 技术在瘤胃微生物群落研究中的应用 | 第35页 |
·DGGE 技术的优点 | 第35-37页 |
第二篇 试验研究 | 第37-99页 |
第一章 放牧地牧草营养分成的季节变化 | 第37-46页 |
前言 | 第37页 |
1 材料与方法 | 第37-41页 |
·试验时间与地点 | 第37-38页 |
·试验地概况 | 第38-39页 |
·试验羊放牧地主要植物群落类群及其分布特征 | 第39页 |
·植物样品的采集与测定 | 第39-40页 |
·尼龙袋法试验 | 第40页 |
·尼龙袋的投放 | 第40页 |
·尼龙袋处理 | 第40页 |
·各营养成分消失率计算 | 第40页 |
·放牧采食量的测定 | 第40-41页 |
·放牧藏系绵羊瘤胃pH 值测定 | 第41页 |
·样品处理及分析 | 第41页 |
·统计方法 | 第41页 |
2 结果 | 第41-43页 |
·牧草的营养成分含量及营养价值 | 第41-42页 |
·放牧绵羊采食量和消化率动态 | 第42页 |
·不同季节放牧绵羊瘤胃pH 值 | 第42-43页 |
3 讨论 | 第43-45页 |
·季节对牧草的营养成分含量及营养价值的影响 | 第43页 |
·季节对放牧绵羊采食量和消化率影响 | 第43-45页 |
4 小结 | 第45-46页 |
第二章 藏系绵羊瘤胃微生物总DNA 的提取 | 第46-54页 |
前言 | 第46页 |
1 材料与方法 | 第46-50页 |
·材料 | 第46-47页 |
·藏系绵羊瘤胃内容物 | 第46页 |
·生化试剂 | 第46-47页 |
·主要仪器 | 第47页 |
·主要分子生物试剂配制 | 第47页 |
·引物 | 第47页 |
·方法 | 第47-50页 |
·瘤胃内容物的采集与处理 | 第48页 |
·DNA 提取方法 | 第48页 |
·DNA 的纯化 | 第48-49页 |
·DNA 提取质量检测 | 第49-50页 |
2 结果分析 | 第50-52页 |
·瘤胃微生物DNA 的提取 | 第50-51页 |
·瘤胃微生物总DNA 的纯化 | 第51-52页 |
3 讨论 | 第52页 |
4 小结 | 第52-54页 |
第三章 用Real time-PCR 技术研究藏系绵羊瘤胃微生物季节变化 | 第54-84页 |
前言 | 第54-55页 |
1 材料与方法 | 第55-61页 |
·材料 | 第55-56页 |
·方法 | 第56-61页 |
·Real-time PCR 定量检测不同季节瘤胃总细菌 | 第56-58页 |
·Real-time PCR 定量检测不同季节瘤胃产甲烷菌总量 | 第58-60页 |
·Real-time PCR 定量检测不同季节瘤胃真菌总量 | 第60-61页 |
·Real-time PCR 定量检测不同季节瘤胃琥珀酸丝状杆菌总量 | 第61页 |
·数据统计与分析 | 第61页 |
2 结果 | 第61-74页 |
·瘤胃细菌16S rDNA Real Time PCR | 第61-66页 |
·瘤胃细菌16S rDNA Real Time PCR 标准曲线制作 | 第61页 |
·模板浓度优化 | 第61-63页 |
·瘤胃细菌Real Time PCR 标准曲线 | 第63-64页 |
·不同季节藏系绵羊瘤胃细菌Real Time PCR 的定量 | 第64-66页 |
·Real Time PCR 定量检测不同季节藏系绵羊瘤胃产甲烷菌 | 第66-69页 |
·瘤胃产甲烷菌Real Time PCR 标准曲线 | 第66-67页 |
·不同季节藏系绵羊瘤胃产甲烷菌Real Time PCR 的定量 | 第67-69页 |
·Real Time PCR 定量检测不同季节藏系绵羊瘤胃真菌 | 第69-71页 |
·瘤胃真菌Real Time PCR 标准曲线 | 第69-70页 |
·不同季节藏系绵羊瘤胃真菌Real Time PCR 的定量 | 第70-71页 |
·Real Time PCR 定量检测不同季节藏系绵羊瘤胃琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes) | 第71-74页 |
·标准曲线 | 第71-73页 |
·不同季节藏系绵羊瘤胃琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)Real Time PCR 的定量 | 第73-74页 |
3 讨论 | 第74-83页 |
·标准曲线的制备 | 第74-75页 |
·季节变化对藏系绵羊瘤胃微生物数量的影响 | 第75-81页 |
·季节变化对藏系绵羊瘤胃细菌数量的影响 | 第76-78页 |
·季节变化对藏系绵羊瘤胃产甲烷菌数量的影响 | 第78-80页 |
·季节变化对藏系绵羊瘤胃真菌数量的影响 | 第80-81页 |
·季节变化对藏系绵羊瘤胃琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)数量的影响 | 第81页 |
·微生物之间的相互作用 | 第81-83页 |
4 小结 | 第83-84页 |
第四章 变性梯度凝胶电泳法研究藏系绵羊瘤胃微生物季节变化 | 第84-97页 |
前言 | 第84-85页 |
1 材料与方法 | 第85-88页 |
·材料 | 第85页 |
·方法 | 第85-88页 |
·计算机分析 | 第88页 |
2 结果与分析 | 第88-93页 |
·不同季节藏系绵羊瘤胃细菌DGGE 图谱分析 | 第88-89页 |
·不同季节瘤胃细菌区系DGGE 图谱相似性分析 | 第89-90页 |
·不同季节瘤胃细菌群体变化规律 | 第90-91页 |
·不同季节藏系绵羊瘤胃细菌多样性分析 | 第91页 |
·不同季节藏系绵羊瘤胃古细菌DGGE 图谱分析 | 第91页 |
·不同季节瘤胃古细菌区系DGGE 图谱相似性分析 | 第91-93页 |
·不同季节藏系绵羊瘤胃古细菌多样性分析 | 第93页 |
3 讨论 | 第93-96页 |
·季节对瘤胃细菌的影响 | 第93-95页 |
·季节对瘤胃古细菌的影响 | 第95页 |
·微生物之间的相互作用对细菌和古细菌多样性的影响 | 第95-96页 |
4 小结 | 第96-97页 |
第五章 总结论 | 第97-98页 |
第六章 论文创新点及需进一步研究的问题 | 第98-99页 |
创新点 | 第98页 |
需进一步研究的问题 | 第98-99页 |
主要参考文献 | 第99-112页 |
个人简介 | 第112页 |
在学期间发表的文章 | 第112-114页 |
导师简介 | 第114页 |